collagen, type II, alpha 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

procollagen, type II, alpha 1, Col2a1, Col2a-1, Dmm, Del1, Collagen alpha-1(II) chain precursor, MGC90638, Col2a

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:1.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:15.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:5.32 小脳:5.73 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.88 脊柱:5.81 網膜:6.20 目:6.36 動脈:- 静脈:5.96 リンパ節:4.71 末梢血:- 脾臓:5.14 胸腺:- 骨髄:6.02 脂肪:5.28 骨:8.40 皮膚:5.31
CAGE 大脳:0.41 小脳:- 脳幹:0.25 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:0.44 網膜:- 目:- 動脈:0 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.14 皮膚:0.15
RNA-seq 大脳:1.91 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:68.90 精巣:7.40 心臓:- 骨格筋:106.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:16.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.09 胎盤:5.48 前立腺:5.49 卵巣:5.10 精巣:7.58 心臓:5.57 骨格筋:5.40 食道:- 胃:5.30 腸:5.16 結腸:- 肝臓:6.10 肺:4.84 膀胱:5.22 腎臓:5.34 下垂体:5.85 甲状腺:- 副腎:5.06 膵臓:6.26 乳腺:5.39 唾液腺:6.58
CAGE 子宮:0 胎盤:0.36 前立腺:0 卵巣:0.25 精巣:0 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:0 腸:0 結腸:0     肝臓:0    肺:0 膀胱:0 腎臓:- 下垂体:0.29 甲状腺:- 副腎:0 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.25 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.63        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_031163
Gene ID 12824
Unigene ID Mm.242315
Probe set ID 1450567_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000022483

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_001844, NM_033150
ラット [0]  

染色体

15F1  [97,806,033  -  97,835,155]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1297453
1618904
1637314
1797232
1879363
1879364
1881905
1885613
1946380
2054384
3070812
3222208
6391574
7276808
7490102
7574296
7590256
7590869
7607069
7750499
7813775
7994081
8020944
8024727
8089190
8192242
8197187
8204907
8305476
8349798
8405667
8563024
8573722
8579897
8621736
8719874
8754852
8872705
8895385
8900172
8912886
8948452
8952549
8989518
9022054
9061018
9061443
9101290
9106663
9112989
9119111
9150484
9164858
9165353
9171829
9182762
9192671
9205941
9232594
9242489
9256352
9264261
9286593
9299161
9389660
9426396
9434954
9449075
9486541
9545508
9614106
9664685
9664687
9671940
9707582
9755172
9811582
9832566
9853964
9874575
9880238
9885252
9915573
9933086
10072440
10072783
10100048
10208739
10213081
10213384
10349636
10352025
10409670
10465785
10473125
10495271
10545953
10556064
10571691
10572046
10579729
10580848
10620515
10631175
10631181
10631182
10633869
10633870
10684250
10686612
10689187
10861287
10886375
10922068
10938126
11042159
11076861
11169848
11171689
11217851
11230154
11237662
11254354
11273670
11285276
11371614
11400162
11472850
11527931
11543619
11566859
11606467
11680679
11691837
11702786
11713230
11792318
11804779
11827796
11839810
11850178
11877774
11900462
11934855
11969258
12000792
12009021
12050144
12056852
12086466
12192060
12198547
12381733
12414734
12434152
12441295
12466851
12477932
12510713
12516572
12525971
12538525
12569124
12571105
12606286
12606408
12646629
12671688
12677004
12677005
12736220
12799063
12814946
12835312
12878728
12883905
12902164
12917109
12917416
12919674
12950088
12968670
14516672
14522949
14610273
14614991
14668414
14722611
14745959
14745966
14749384
15030764
15031101
15039145
15042706
15050892
15107406
15123739
15132997
15141750
15162503
15206957
15210554
15296947
15305294
15355562
15355563
15389629
15476249
15489334
15509771
15531369
15533830
15537544
15562585
15582152
15619674
15633171
15652702
15660420
15689378
15699338
15713743
15741244
15777636
15778499
15781876
15800003
15800063
15841179
15843801
15866163
15872058
15908193
15955062
15975938
16007336
16015334
16076844
16079159
16109715
16141072
16141073
16169709
16207730
16236767
16326388
16332269
16356873
16387856
16504022
16537363
16537395
16537572
16537906
16546167
16556917
16598734
16602821
16678811
16791844
16818445
16857753
16894608
16905550
16935278
17024418
17035289
17050674
17065231
17099713
17138667
17182356
17191253
17194222
17289022
17313942
17317783
17331945
17336904
17359303
17418107
17470636
17477400
17481601
17510210
17519362
17544391
17576802
17579353
17591962
17593974
17644814
17652426
17660199
17670790
17683922
17698054
17699607
17720815
17764670
17913788
17952091
17967876
18025304
18052755
18053235
18061568
18156182
18191120
18213582
18234177
18377888
18380899
18434416
18456591
18514492
18539921
18579360
18594453
18597638
18617520
18651652
18663357
18678883
18680740
18691704
18692041
18759297
18779865
18832069
18984342
19000668
19075394
19097117
19097194
19185060
19219044
19224984
19235716
19252479
19261698
19272164
19273610
19304887
19356224
19358209
19378260
19389373
19389374
19419310
19419317
19441084
19460349
19464280
19465597
19478656
19521500
19557172
19605502
19633173
19653325
19710088
19712269
19725955
19737917
19755491
19762422
19767744
19769959
19777594
19853894
19906842
19906844
19906978
19932774
19948490
19956613
20010698
20034104
20059955
20059976
20089971
20129696
20152828
20179096
20181744
20206616
20236942
20335360
20346939
20347762
20368361
20403959
20404326
20414703
20440000
20458143
20458606
20466812
20495570
20501701
20513134
20530870
20576618
20593419
20660756
20730911
20812917
20881014
20940257
20951345
20978074
21148187
21148564
21156168
21177286
21185280
21217667
21228004
21262216
21267068
21297010
21367821
21420501
21445361
21447558
21454303
21455939
21467034
21482757
21484342
21494559
21538020
21538804
21606205
21624478
21677750
21807129
21826198
21872590
21911092
21917142
21935430
21939397
21940677
21945074
21953591
21984813
22028304
22049074
22072985
22155508
22190639
22206015
22206865
22242143
22248926
22275070
22280990
22290230
22318228
22337375
22387309
22421594
22427063
22465667
22492985
22493482
22496664
22547066
22595668
22708793
22761446
22815835
22833566
22843502
22869368
22876201
22885149
22916278
22972626
23009899
23026747
23034633
23038774
23095887
23133648
23238123
23239042
23239739
23274346
23326237
23333759
23423383
23458899
23475960
23481305
23501471
23555635
23633963
23720048
23727513
23762363
23776616
23792766
23839921
23863482
23891934
23994637
24161523
24191021
24218567
24218621
24269712
24344131
24550287

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0060348  bone development
GO:0001502  cartilage condensation
GO:0051216  cartilage development
GO:0060351  cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis
GO:0002062  chondrocyte differentiation
GO:0030199  collagen fibril organization
GO:0060272  embryonic skeletal joint morphogenesis
GO:0001958  endochondral ossification
GO:0003007  heart morphogenesis
GO:0048839  inner ear development
GO:0042472  inner ear morphogenesis
GO:0035108  limb morphogenesis
GO:0060021  palate development
GO:0006029  proteoglycan metabolic process
GO:0010468  regulation of gene expression
GO:0007605  sensory perception of sound
GO:0001501  skeletal system development
GO:0048705  skeletal system morphogenesis
GO:0001894  tissue homeostasis
GO:0007601  visual perception

Cellular Component

GO:0005604  basement membrane
GO:0005581  collagen
GO:0005585  collagen type II
GO:0005737  cytoplasm
GO:0031012  extracellular matrix
GO:0005576  extracellular region
GO:0005615  extracellular space
GO:0005578  proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005201  extracellular matrix structural constituent
GO:0042802  identical protein binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0048407  platelet-derived growth factor binding