collagen, type I, alpha 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

Col1a1, procollagen, type I, alpha 1, Collagen alpha-1(I) chain precursor, Cola-1, Cola1, Mov13, Mov-13, Col1a-1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:192.80 小脳:18.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:4898.20 末梢神経:554.10 脊柱:47.30 網膜:- 目:433.10 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:14.40 脾臓:131.70 胸腺:- 骨髄:12.80 脂肪:212.70 骨:5247.70 皮膚:1543.90
GeneChip 大脳:6.55 小脳:6.03 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.98 脊柱:8 網膜:5.76 目:6.02 動脈:- 静脈:14.42 リンパ節:10.37 末梢血:- 脾臓:8.67 胸腺:- 骨髄:8.38 脂肪:11.11 骨:13.75 皮膚:12.08
CAGE 大脳:1.46 小脳:- 脳幹:1.78 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.89 網膜:- 目:- 動脈:5.22 静脈:- リンパ節:3.35 末梢血:- 脾臓:3.11 胸腺:2.07 骨髄:- 脂肪:- 骨:7.14 皮膚:8.09
RNA-seq 大脳:7.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:130.90 胎盤:82.80 前立腺:648.50 卵巣:68.90 精巣:88.70 心臓:241.80 骨格筋:177.50 食道:- 胃:196.40 腸:- 結腸:246.70     肝臓:18.10        肺:210.90    膀胱:- 腎臓:217.60 下垂体:77.50 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:75.10 乳腺:845.60 唾液腺:162
GeneChip 子宮:13.47 胎盤:9.73 前立腺:10.41 卵巣:12.20 精巣:8.47 心臓:10.57 骨格筋:11.97 食道:- 胃:10.57 腸:9.41 結腸:- 肝臓:7.05 肺:11 膀胱:13.25 腎臓:8.04 下垂体:7.82 甲状腺:- 副腎:8.28 膵臓:10.10 乳腺:11.95 唾液腺:11.01
CAGE 子宮:7.12 胎盤:5.10 前立腺:3.72 卵巣:5.99 精巣:1.48 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:4.27 腸:4.26 結腸:3.49     肝臓:2.35    肺:4.44 膀胱:6.44 腎臓:- 下垂体:2.61 甲状腺:- 副腎:3.44 膵臓:3.74 乳腺:5.71 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:19.90 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.92        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_007742
Gene ID 12842
Unigene ID Mm.277735
Probe set ID 1423669_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000001506

オーソログ対応遺伝子

ヒト[8]  NM_000088
ラット[3]  NM_053304

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1524678
1537326
1618338
1744131
1761577
1794049
1879336
1879363
2054384
2097519
2209468
2387241
2402497
2450280
2567264
2824282
3116273
3172346
3340560
3467899
3841523
3960120
6219867
6298597
6308457
6324198
6825169
6857446
7237558
7573384
7574488
7589890
7593259
7598807
7629088
7704020
7775585
7790374
7813775
7873289
7919967
7924138
7937772
7964480
7964554
8018053
8022775
8026631
8065328
8096090
8096378
8097422
8106463
8113105
8130375
8146196
8163675
8204907
8240330
8268229
8328969
8369292
8373351
8408623
8449498
8524319
8535610
8563024
8569173
8577708
8619363
8683100
8686743
8702912
8747929
8783182
8785585
8806434
8851045
8900172
8906420
8944545
8952549
8984825
8986815
8988177
9030551
9101290
9164858
9213002
9286593
9390635
9415455
9426396
9556061
9584177
9664687
9755172
9796779
9801322
9832566
9853961
9880238
9887097
9922384
10021460
10072783
10213384
10349636
10357935
10429947
10473125
10545953
10608859
10633870
10780854
10878613
10922068
10995453
11032854
11042159
11076861
11124519
11180952
11217851
11230154
11358497
11566859
11606467
11685542
11702786
11705995
11713230
11784073
11792318
11804779
11813254
11839810
11882659
11900462
11934855
11969258
12192060
12434152
12438746
12466851
12477932
12524684
12540776
12571105
12592609
12657595
12755333
12756187
12807961
12837285
12855673
12878728
12933685
14499643
14559231
14614858
14617570
14627958
14630726
14660441
14688224
14758483
14980515
15005849
15022335
15030764
15039145
15042706
15107406
15121863
15161848
15162503
15207743
15246109
15383546
15451791
15456762
15489334
15536133
15537544
15548578
15576404
15578713
15653467
15659034
15689378
15741244
15781699
15782199
15866163
15866165
15882627
15963767
15975938
16007336
16049333
16109715
16141072
16141073
16183868
16192629
16311053
16326388
16356873
16368934
16400644
16446138
16452166
16537906
16556917
16602821
16751105
16813523
16815385
16971509
17014841
17018525
17024418
17029294
17050674
17099713
17135260
17141628
17142326
17143598
17177285
17194222
17204263
17330941
17336904
17430895
17440987
17449229
17453912
17510195
17510210
17544391
17548469
17554301
17595534
17654495
17662583
17705049
17764670
17881772
17950069
17980593
17986615
18025304
18052755
18056424
18061568
18067859
18211825
18234177
18248096
18285337
18299419
18313657
18371336
18414679
18424556
18442412
18487609
18554416
18556780
18559979
18606782
18612084
18639653
18667463
18684089
18684439
18759297
18779865
18799693
18816857
18819932
18832069
18973680
19008372
19060879
19153555
19162043
19185060
19191514
19196966
19197242
19217425
19224984
19235716
19235726
19304887
19307728
19356224
19357194
19378260
19389359
19414862
19418583
19419310
19469869
19560165
19590010
19605502
19653325
19690389
19734317
19737917
19762422
19797236
19853894
19933329
19948490
20010698
20010831
20010832
20025746
20059955
20059976
20080568
20142103
20179096
20193675
20218816
20223936
20237296
20368361
20430747
20440000
20458143
20463013
20498044
20512147
20515681
20541046
20548288
20551517
20616797
20654714
20696843
20708079
20830701
20852040
20858856
20864640
20877012
20881014
20881139
20944625
20952506
20970343
21067603
21095332
21148188
21150166
21185280
21193410
21289056
21364421
21367821
21376238
21425413
21447555
21458673
21467034
21478499
21482754
21494559
21511879
21512159
21557453
21571217
21606205
21613984
21625049
21643937
21677750
21707943
21718087
21746880
21775118
21779369
21788370
21807129
21907137
21907695
21911092
21934140
21939397
21944754
21949390
21962509
21979435
21987724
21989989
22020333
22022457
22093826
22096492
22113163
22155508
22158707
22171010
22194864
22206865
22207275
22232675
22301776
22308401
22318228
22325288
22354840
22363786
22427063
22432025
22434869
22437311
22438570
22469981
22492985
22493482
22508542
22511244
22546693
22560297
22564414
22573318
22573622
22589248
22589746
22673621
22682244
22687751
22690110
22791294
22843502
22843703
22869368
22869756
22883231
22885149
22902753
23022097
23023126
23034633
23064687
23133399
23143395
23222438
23237810
23243279
23254193
23273220
23274346
23281395
23311625
23322734
23325759
23326559
23333738
23371561
23377784
23378032
23423975
23544078
23567158
23604553
23615282
23650387
23666760
23680150
23680479
23684984
23720048
23762363
23774443
23791176
23791530
23824573
23827711
23830207
23863479
23907538
23918805
23966707
23991045
24019537
24029918
24046351
24192035
24209617
24284212
24336202
24446491
24451543
24711581
24715455

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001568  blood vessel development
GO:0060346  bone trabecula formation
GO:0060351  cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis
GO:0071230  cellular response to amino acid stimulus
GO:0032964  collagen biosynthetic process
GO:0030199  collagen fibril organization
GO:0048706  embryonic skeletal system development
GO:0001958  endochondral ossification
GO:0060325  face morphogenesis
GO:0001957  intramembranous ossification
GO:0010812  negative regulation of cell-substrate adhesion
GO:0030335  positive regulation of cell migration
GO:0010718  positive regulation of epithelial to mesenchymal transition
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0070208  protein heterotrimerization
GO:0034504  protein localization in nucleus
GO:0015031  protein transport
GO:0007605  sensory perception of sound
GO:0001501  skeletal system development
GO:0048705  skeletal system morphogenesis
GO:0043588  skin development
GO:0043589  skin morphogenesis
GO:0034505  tooth mineralization
GO:0007601  visual perception
GO:0042060  wound healing

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0005584  collagen type I
GO:0005737  cytoplasm
GO:0031012  extracellular matrix
GO:0005576  extracellular region
GO:0005615  extracellular space
GO:0005578  proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005201  extracellular matrix structural constituent
GO:0042802  identical protein binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0048407  platelet-derived growth factor binding
GO:0005515  protein binding