CCCTC-binding factor

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同義遺伝子名

Ctcf, AW108038, 11-zinc finger protein, Transcriptional repressor CTCF, CCCTC-binding factor, CTCFL paralog

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:86.80

小脳:92.10

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:96.40

目:174.80

動脈:84.40

静脈:-

リンパ節:32.40

末梢血:115

脾臓:210.70

胸腺:138.30

骨髄:64.10

脂肪:-

骨:37.60

皮膚:47.50

GeneChip

大脳:8.09

小脳:8.49

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:7.60

脊柱:7.57

網膜:8.39

目:7.90

動脈:-

静脈:8.27

リンパ節:9.36

末梢血:-

脾臓:9.19

胸腺:-

骨髄:9.85

脂肪:7.86

骨:9.73

皮膚:8.56

CAGE

大脳:4.24

小脳:-

脳幹:3.85

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:3.69

網膜:-

目:-

動脈:3.99

静脈:-

リンパ節:5.13

末梢血:-

脾臓:4.73

胸腺:5.31

骨髄:-

脂肪:-

骨:4.61

皮膚:4.77

RNA-seq

大脳:7.31

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:87.20

胎盤:41.40

前立腺:-

卵巣:57.50

精巣:7.40

心臓:18.60

骨格筋:-

食道:-

胃:32.70

腸:37

結腸:35.20

肝臓:9.10

肺:60.30

膀胱:-

腎臓:24.20

下垂体:51.70

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:103.20

乳腺:117.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.62

胎盤:7.69

前立腺:8.35

卵巣:8.52

精巣:6.94

心臓:7.64

骨格筋:8.19

食道:-

胃:8.12

腸:8.49

結腸:-

肝臓:7.71

肺:8.41

膀胱:8.23

腎臓:7.87

下垂体:8.13

甲状腺:-

副腎:8.56

膵臓:7.48

乳腺:8.22

唾液腺:8

CAGE

子宮:3.98

胎盤:3.75

前立腺:3.70

卵巣:3.94

精巣:3.43

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:3.80

腸:3.94

結腸:3.79

肝臓:3.66

肺:4.23

膀胱:3.93

腎臓:-

下垂体:3.78

甲状腺:-

副腎:3.73

膵臓:3.97

乳腺:3.79

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:3.17

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:5.19

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_181322
Gene ID	13018
Unigene ID	Mm.269474
Probe set ID	1418330_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000005698

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]	NM_001191022, NM_006565
ラット[1]	NM_031824, NM_006565

染色体

8D3 [108,160,468 - 108,206,822]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015880	Zinc finger, C2H2-like
IPR007087	Zinc finger, C2H2-type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016568	chromatin modification
GO:0007059	chromosome segregation
GO:0006306	DNA methylation
GO:0009048	dosage compensation, by inactivation of X chromosome
GO:0006349	genetic imprinting
GO:0010216	maintenance of DNA methylation
GO:0010629	negative regulation of gene expression
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0016584	nucleosome positioning
GO:0010628	positive regulation of gene expression
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0040029	regulation of gene expression, epigenetic
GO:0035065	regulation of histone acetylation
GO:0031060	regulation of histone methylation
GO:0040030	regulation of molecular function, epigenetic
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005694	chromosome
GO:0000775	chromosome, centromeric region
GO:0000793	condensed chromosome
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0043035	chromatin insulator sequence binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0003676	nucleic acid binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity

CCCTC-binding factor

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function