high mobility group 20 B

同義遺伝子名

Smarce1r, Structural DNA-binding protein BRAF35, Braf35, Hmg20b, HMG domain protein HMG20B, BRAF35, AW610687, SMARCE1-related protein, BRCA2-associated factor 35, high mobility group 20 B, Hmgx2

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:9.90

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:5.78

小脳:6.22

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:6.43

脊柱:6.37

網膜:5.57

目:6.37

動脈:-

静脈:6.70

リンパ節:7.05

末梢血:-

脾臓:6.89

胸腺:-

骨髄:6.99

脂肪:7.27

骨:6.29

皮膚:6.85

CAGE

大脳:2.81

小脳:-

脳幹:2.79

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:2.96

網膜:-

目:-

動脈:3.39

静脈:-

リンパ節:4.11

末梢血:-

脾臓:3.20

胸腺:3.41

骨髄:-

脂肪:-

骨:2.59

皮膚:4.00

RNA-seq

大脳:5.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.66

胎盤:7.05

前立腺:7.43

卵巣:7.25

精巣:6.85

心臓:7.14

骨格筋:6.84

食道:-

胃:7.50

腸:7.70

結腸:-

肝臓:6.91

肺:7.12

膀胱:6.70

腎臓:7.18

下垂体:6.80

甲状腺:-

副腎:7.46

膵臓:6.45

乳腺:6.76

唾液腺:7.33

CAGE

子宮:3.42

胎盤:3.49

前立腺:3.58

卵巣:3.46

精巣:3.27

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:3.91

腸:3.40

結腸:3.64

肝臓:3.35

肺:3.48

膀胱:3.43

腎臓:-

下垂体:3.50

甲状腺:-

副腎:3.20

膵臓:3.53

乳腺:3.26

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:3.73

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:7.33

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001163165
Gene ID	15353
Unigene ID	Mm.384745
Probe set ID	1417637_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000020232

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]	NM_006339
ラット[1]	NM_001108731

染色体

10C1 [80,808,793 - 80,813,225]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910	High mobility group, HMG1/HMG2
IPR000135	High mobility group, HMG1/HMG2, subgroup
IPR009071	High mobility group, superfamily

GO:0007049	cell cycle
GO:0016568	chromatin modification
GO:0006325	chromatin organization
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0033234	negative regulation of protein sumoylation
GO:0045666	positive regulation of neuron differentiation
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

GO:0002111	BRCA2-BRAF35 complex
GO:0005694	chromosome
GO:0000794	condensed nuclear chromosome
GO:0005634	nucleus

GO:0003677	DNA binding
GO:0000400	four-way junction DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046982	protein heterodimerization activity
GO:0003700	transcription factor activity

high mobility group 20 B

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function