3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A lyase

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同義遺伝子名

Hmgcl, HL, AW476067, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A lyase, 3-hydroxy-3-methylglutarate-CoA lyase, HMG-CoA lyase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:90.30 小脳:405.30 脳幹:286 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:19.10 脊柱:141.90 網膜:32.10 目:38 動脈:675.10 静脈:- リンパ節:108 末梢血:14.40 脾臓:- 胸腺:247 骨髄:- 脂肪:- 骨:187.90 皮膚:79.20
GeneChip 大脳:8.50 小脳:9.38 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.84 脊柱:8.43 網膜:8.50 目:9.19 動脈:- 静脈:8.85 リンパ節:9.33 末梢血:- 脾臓:8.99 胸腺:- 骨髄:9.59 脂肪:9.64 骨:9.33 皮膚:8.91
CAGE 大脳:3.08 小脳:- 脳幹:2.94 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.74 網膜:- 目:- 動脈:3.03 静脈:- リンパ節:2.38 末梢血:- 脾臓:2.95 胸腺:2.66 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.28 皮膚:2.66
RNA-seq 大脳:7.88 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:165.70 前立腺:61.80 卵巣:57.50 精巣:22.20 心臓:130.20 骨格筋:106.50 食道:- 胃:360 腸:184.90 結腸:158.60     肝臓:334.90        肺:351.50    膀胱:463.30 腎臓:201.50 下垂体:12.90 甲状腺:224.90 副腎:- 膵臓:103.20 乳腺:163.20 唾液腺:54
GeneChip 子宮:9.01 胎盤:10.28 前立腺:9.61 卵巣:8.96 精巣:7.71 心臓:9.55 骨格筋:9.08 食道:- 胃:10.38 腸:9.96 結腸:- 肝臓:11.54 肺:9.09 膀胱:9.25 腎臓:10.55 下垂体:8.40 甲状腺:- 副腎:9.01 膵臓:8.72 乳腺:9.23 唾液腺:9.17
CAGE 子宮:2.86 胎盤:3.44 前立腺:3.55 卵巣:2.56 精巣:1.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.87 腸:3.95 結腸:3.72     肝臓:5.11    肺:3.01 膀胱:3.22 腎臓:- 下垂体:2.95 甲状腺:- 副腎:3.05 膵臓:2.56 乳腺:3.10 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:8.07 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:45.23        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_008254
Gene ID 15356
Unigene ID Mm.439940
Probe set ID 1424639_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000028672

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_000191, NM_001166059
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR013785  Aldolase-type TIM barrel
IPR000891  Pyruvate carboxyltransferase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7873878
8102917
8617516
9003443
9680378
9817922
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12855751
12865426
14610273
14651853
14681479
15782199
16141072
16141073
16916647
18614015
21267068
23861731

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006637  acyl-CoA metabolic process
GO:0009790  embryonic development
GO:0046951  ketone body biosynthetic process
GO:0007005  mitochondrion organization
GO:0051262  protein tetramerization

Cellular Component

GO:0005743  mitochondrial inner membrane
GO:0005739  mitochondrion
GO:0005777  peroxisome

Molecular Function

GO:0000062  acyl-CoA binding
GO:0031406  carboxylic acid binding
GO:0003824  catalytic activity
GO:0004419  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase activity
GO:0016829  lyase activity
GO:0000287  magnesium ion binding
GO:0030145  manganese ion binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0005102  receptor binding