histone deacetylase 10

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同義遺伝子名

histone deacetylase 10, Hdac10, AW548891, Histone deacetylase 10, HD10

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:64.30 小脳:110.50 脳幹:63.60 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:152.90 脊柱:94.60 網膜:- 目:30.40 動脈:253.20 静脈:- リンパ節:75.60 末梢血:28.80 脾臓:26.30 胸腺:168 骨髄:25.60 脂肪:- 骨:37.60 皮膚:15.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.16 小脳:- 脳幹:1.52 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:1.85 網膜:- 目:- 動脈:1.91 静脈:- リンパ節:2.87 末梢血:- 脾臓:2.59 胸腺:2.57 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.97 皮膚:2.21
RNA-seq 大脳:2.37 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:68.90 精巣:22.20 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:35.20     肝臓:72.40        肺:90.40    膀胱:- 腎臓:80.60 下垂体:51.70 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:28.10 乳腺:35.90 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.26 胎盤:1.74 前立腺:2.33 卵巣:2.06 精巣:0.45 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.75 腸:1.70 結腸:1.96     肝臓:1.64    肺:2.59 膀胱:1.86 腎臓:- 下垂体:2.32 甲状腺:- 副腎:1.70 膵臓:3.10 乳腺:1.98 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.89 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.75        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_199198
Gene ID 170787
Unigene ID Mm.203954
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000062906

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001159286, NM_032019
ラット [0]  

染色体

15E3  [88,953,733  -  88,959,130]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000286  Histone deacetylase superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
11677242
12466851
12477932
15489334
16141072
16141073
16602821
18824292
18926829
20059953
20211142
21267068
21731673

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0016575  histone deacetylation
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006476  protein amino acid deacetylation
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0000118  histone deacetylase complex
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0019899  enzyme binding
GO:0004407  histone deacetylase activity
GO:0031078  histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0034739  histone deacetylase activity (H3-K16 specific)
GO:0032129  histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0042826  histone deacetylase binding
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0032041  NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969  NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970  NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0033558  protein deacetylase activity