eukaryotic translation initiation factor 4A, isoform 3

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同義遺伝子名

DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 48, mKIAA0111, DEAD box protein 48, MGC6715, MGC6664, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX48, Ddx48, 2400003O03Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:79.90 小脳:36.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:1624.20 脊柱:94.60 網膜:289.30 目:38 動脈:- 静脈:- リンパ節:2181.90 末梢血:402.60 脾臓:5029.60 胸腺:69.20 骨髄:38195.20 脂肪:- 骨:112.70 皮膚:158.40
GeneChip 大脳:9.41 小脳:9.54 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.53 脊柱:9.33 網膜:9.26 目:9.13 動脈:- 静脈:9.87 リンパ節:10.47 末梢血:- 脾臓:10.34 胸腺:- 骨髄:10.47 脂肪:9.80 骨:10.37 皮膚:9.78
CAGE 大脳:3.60 小脳:- 脳幹:3.71 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.70 網膜:- 目:- 動脈:3.44 静脈:- リンパ節:3.86 末梢血:- 脾臓:4.12 胸腺:4.30 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.33 皮膚:3.74
RNA-seq 大脳:20.76 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:610.70 胎盤:151.90 前立腺:61.80 卵巣:137.90 精巣:73.90 心臓:111.60 骨格筋:- 食道:- 胃:98.20 腸:- 結腸:52.90     肝臓:72.40        肺:190.80    膀胱:198.50 腎臓:3747.60 下垂体:297.10 甲状腺:337.40 副腎:- 膵臓:84.40 乳腺:143.70 唾液腺:216
GeneChip 子宮:10.19 胎盤:9.86 前立腺:10.17 卵巣:10.13 精巣:9.92 心臓:9.43 骨格筋:9.16 食道:- 胃:9.84 腸:10.02 結腸:- 肝臓:9.57 肺:9.92 膀胱:9.60 腎臓:9.54 下垂体:10.13 甲状腺:- 副腎:9.47 膵臓:9.18 乳腺:9.81 唾液腺:9.85
CAGE 子宮:3.81 胎盤:4.06 前立腺:3.99 卵巣:3.66 精巣:4.67 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.94 腸:3.80 結腸:3.93     肝臓:3.79    肺:3.90 膀胱:3.68 腎臓:- 下垂体:4.06 甲状腺:- 副腎:3.81 膵臓:3.36 乳腺:3.97 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:9.20 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:12.02        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_138669
Gene ID 192170
Unigene ID Mm.197555
Probe set ID 1417242_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000025580

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_014740
ラット[1]  NM_014740

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
14621295
15489334
15782199
16141072
16141073
18480465
19435936
20360068
21267068
21460039
23431134
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0017148  negative regulation of translation
GO:0000184  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0048026  positive regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045727  positive regulation of translation

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0035145  exon-exon junction complex
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0004004  ATP-dependent RNA helicase activity
GO:0008143  poly(A) RNA binding