protein tyrosine phosphatase, receptor type, R

同義遺伝子名

protein tyrosine phosphatase, receptor type, R, PTPBR7, Protein-tyrosine-phosphatase SL, Ptprr, Ptp13, Gmcp1, Phosphotyrosine phosphatase 13, PTP-SL, mPTP213, STEP-like PTPase

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:33

小脳:276.30

脳幹:31.80

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:191.10

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:15.80

GeneChip

大脳:7.23

小脳:10.09

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:8.39

脊柱:6.44

網膜:5.90

目:4.83

動脈:-

静脈:4.79

リンパ節:4.45

末梢血:-

脾臓:4.24

胸腺:-

骨髄:4.43

脂肪:5.06

骨:4.87

皮膚:4.78

CAGE

大脳:4.37

小脳:-

脳幹:3.39

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:3.31

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:-

リンパ節:0.42

末梢血:-

脾臓:0.16

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:-

骨:0

皮膚:0.40

RNA-seq

大脳:3.11

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:160.90

精巣:14.80

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:32.70

腸:-

結腸:35.20

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.63

胎盤:6.06

前立腺:4.78

卵巣:6.12

精巣:5.49

心臓:5.77

骨格筋:5.60

食道:-

胃:7.55

腸:9.06

結腸:-

肝臓:4.59

肺:5.16

膀胱:8.42

腎臓:5.11

下垂体:5.83

甲状腺:-

副腎:5.79

膵臓:5

乳腺:4.79

唾液腺:4.64

CAGE

子宮:2.68

胎盤:1.60

前立腺:1.46

卵巣:0.99

精巣:0

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:2.04

腸:3.28

結腸:4.20

肝臓:0

肺:0.17

膀胱:3.53

腎臓:-

下垂体:2.22

甲状腺:-

副腎:1.92

膵臓:1.61

乳腺:0

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:0.82

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:0

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001161840
Gene ID	19279
Unigene ID	Mm.336316
Probe set ID	1426047_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000020151

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]	NM_001207015, NM_001207016, NM_002849, NM_130846
ラット[2]	NM_001113390, NM_053594, NM_002849, NM_130846

染色体

10D2 [115,455,269 - 115,711,988]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008356	Protein-tyrosine phosphatase, KIM-containing
IPR016334	Protein-tyrosine phosphatase, receptor type R/non-receptor type 5
IPR000242	Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016311	dephosphorylation
GO:0006470	protein amino acid dephosphorylation

Cellular Component

GO:0009986	cell surface
GO:0005737	cytoplasm
GO:0016021	integral to membrane
GO:0016020	membrane
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0016787	hydrolase activity
GO:0016791	phosphatase activity
GO:0004721	phosphoprotein phosphatase activity
GO:0019901	protein kinase binding
GO:0004725	protein tyrosine phosphatase activity

protein tyrosine phosphatase, receptor type, R

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function