SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1

同義遺伝子名

Snf5l1, mSNF5, MGC132387, Integrase interactor 1 protein, SNF5/INI1, integrase interactor 1, Snf5, Smarcb1, Ini1, Baf47, AU020204

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:191

小脳:92.10

脳幹:95.30

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:19.10

脊柱:94.60

網膜:321.40

目:152

動脈:-

静脈:-

リンパ節:64.80

末梢血:100.60

脾臓:39.50

胸腺:49.40

骨髄:51.30

脂肪:-

骨:37.60

皮膚:134.60

GeneChip

大脳:9.03

小脳:9.04

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:8.85

脊柱:8.66

網膜:7.80

目:7.68

動脈:-

静脈:8.87

リンパ節:9.08

末梢血:-

脾臓:9.12

胸腺:-

骨髄:9.07

脂肪:8.71

骨:8.72

皮膚:8.37

CAGE

大脳:4.33

小脳:-

脳幹:4.31

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:4.20

網膜:-

目:-

動脈:3.91

静脈:-

リンパ節:3.75

末梢血:-

脾臓:4.12

胸腺:4.15

骨髄:-

脂肪:-

骨:4.11

皮膚:3.90

RNA-seq

大脳:15.38

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:174.50

胎盤:96.70

前立腺:30.90

卵巣:57.50

精巣:73.90

心臓:18.60

骨格筋:213

食道:-

胃:-

腸:147.90

結腸:17.60

肝臓:45.30

肺:120.50

膀胱:-

腎臓:137

下垂体:64.60

甲状腺:112.50

副腎:-

膵臓:37.50

乳腺:91.40

唾液腺:54

GeneChip

子宮:9.42

胎盤:8.83

前立腺:8.42

卵巣:9.60

精巣:9.20

心臓:7.90

骨格筋:8.21

食道:-

胃:8.62

腸:8.92

結腸:-

肝臓:8.47

肺:8.85

膀胱:8.55

腎臓:8.45

下垂体:8.99

甲状腺:-

副腎:8.77

膵臓:7.64

乳腺:8.54

唾液腺:7.99

CAGE

子宮:4.30

胎盤:4.27

前立腺:3.68

卵巣:4.46

精巣:4.68

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:3.85

腸:4.01

結腸:3.88

肝臓:3.30

肺:4.02

膀胱:3.95

腎臓:-

下垂体:4.25

甲状腺:-

副腎:4.14

膵臓:3.21

乳腺:3.59

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:4.17

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:3.51

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001161853
Gene ID	20587
Unigene ID	Mm.279751
Probe set ID	1416045_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000000902

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]	NM_001007468, NM_003073
ラット [0]

染色体

10C1 [75,359,514 - 75,384,362]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006939	SNF5/SMARCB1/INI1
IPR017393	SWI/SNF chromatin-remodeling complex, component hSNF5/Ini1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0043044	ATP-dependent chromatin remodeling
GO:0001824	blastocyst development
GO:0001835	blastocyst hatching
GO:0007049	cell cycle
GO:0030154	cell differentiation
GO:0016568	chromatin modification
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0006281	DNA repair
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0007399	nervous system development
GO:0006337	nucleosome disassembly
GO:0043923	positive regulation by host of viral transcription
GO:0051091	positive regulation of transcription factor activity
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0045090	retroviral genome replication
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000228	nuclear chromosome
GO:0005634	nucleus
GO:0016514	SWI/SNF complex
GO:0001741	XY body

Molecular Function

GO:0002039	p53 binding
GO:0005515	protein binding
GO:0030957	Tat protein binding
GO:0003713	transcription coactivator activity

SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function