elongation factor Tu GTP binding domain containing 2

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同義遺伝子名

U5-116 kDa, U5 snRNP-specific protein, 116 kDa, 116kDa, Eftud2, U5-116kD, Snrp116, Elongation factor Tu GTP-binding domain protein 2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:7.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:9.95 小脳:10.04 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.54 脊柱:9.32 網膜:8.59 目:8.62 動脈:- 静脈:9.42 リンパ節:10.27 末梢血:- 脾臓:10.32 胸腺:- 骨髄:10.74 脂肪:9.10 骨:10.24 皮膚:8.98
CAGE 大脳:4.01 小脳:- 脳幹:3.69 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.76 網膜:- 目:- 動脈:3.13 静脈:- リンパ節:3.92 末梢血:- 脾臓:4.23 胸腺:3.81 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.17 皮膚:3.75
RNA-seq 大脳:14.04 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:36.90 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:10.11 胎盤:9.34 前立腺:9.49 卵巣:10.18 精巣:10.03 心臓:8.74 骨格筋:8.32 食道:- 胃:9.36 腸:9.69 結腸:- 肝臓:8.84 肺:9.32 膀胱:9.47 腎臓:9.16 下垂体:9.45 甲状腺:- 副腎:9.32 膵臓:7.82 乳腺:9.36 唾液腺:8.68
CAGE 子宮:3.73 胎盤:3.64 前立腺:3.21 卵巣:3.66 精巣:4.48 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.95 腸:3.71 結腸:3.45     肝臓:3.08    肺:3.64 膀胱:3.43 腎臓:- 下垂体:3.55 甲状腺:- 副腎:3.31 膵臓:2.45 乳腺:3.45 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:3.59 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:4.54        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001109995
Gene ID 20624
Unigene ID Mm.87305
Probe set ID 1438835_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000020929

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001142605, NM_004247
ラット[2]  NM_001142605, NM_004247

染色体

11E1  [102,699,787  -  102,742,299]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR009022  Elongation factor G/III/V
IPR020568  Ribosomal protein S5 domain 2-type fold
IPR014721  Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup
IPR005225  Small GTP-binding protein
IPR000640  Translation elongation factor EFG/EF2, C-terminal
IPR005517  Translation elongation factor EFG/EF2, domain IV

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9233818
10349636
10922068
11042159
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14691545
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15489334
15782199
16141072
16141073
17967808
18799693
21267068
21677750
24361939
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0008380  RNA splicing
GO:0006412  translation
GO:0006414  translational elongation

Cellular Component

GO:0015030  Cajal body
GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0016607  nuclear speck
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0005525  GTP binding
GO:0003924  GTPase activity
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003746  translation elongation factor activity