SRY-box containing gene 5

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同義遺伝子名

Sox5, MGC124352, Transcription factor SOX-5, Sox-5, AI528773, SRY-box containing gene 5

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:38.20

小脳:110.50

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:38.20

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.50

皮膚:23.80

GeneChip

大脳:7.02

小脳:6.87

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:5.90

脊柱:6.93

網膜:6.15

目:6.08

動脈:-

静脈:6.38

リンパ節:5.37

末梢血:-

脾臓:5.89

胸腺:-

骨髄:5.18

脂肪:6.02

骨:5.34

皮膚:5.32

CAGE

大脳:2.50

小脳:-

脳幹:2.22

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:2.23

網膜:-

目:-

動脈:3.46

静脈:-

リンパ節:2.11

末梢血:-

脾臓:2.08

胸腺:0.95

骨髄:-

脂肪:-

骨:1.02

皮膚:2.71

RNA-seq

大脳:2.37

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:13.80

前立腺:-

卵巣:23

精巣:192.10

心臓:-

骨格筋:35.50

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:9.10

肺:20.10

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:35.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.59

胎盤:6.53

前立腺:5.42

卵巣:6.83

精巣:9.99

心臓:6.51

骨格筋:6.16

食道:-

胃:5.89

腸:5.51

結腸:-

肝臓:7.05

肺:6.18

膀胱:6.08

腎臓:6.03

下垂体:6.69

甲状腺:-

副腎:6.28

膵臓:6.58

乳腺:5.92

唾液腺:5.69

CAGE

子宮:3.07

胎盤:2.31

前立腺:1.46

卵巣:3.40

精巣:6.51

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:0

腸:1.29

結腸:1.19

肝臓:3.27

肺:2.94

膀胱:2.47

腎臓:-

下垂体:2.71

甲状腺:-

副腎:3.17

膵臓:2.03

乳腺:1.51

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:0.81

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:1.98

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001113559
Gene ID	20678
Unigene ID	Mm.1752
Probe set ID	1432189_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000041540

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]	NM_006940, NM_152989, NM_178010
ラット[3]	NM_006940, NM_152989, NM_178010

染色体

6G3 [143,776,945 - 144,730,497]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910	High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071	High mobility group, superfamily

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0051216	cartilage development
GO:0045165	cell fate commitment
GO:0021953	central nervous system neuron differentiation
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0048709	oligodendrocyte differentiation
GO:0032332	positive regulation of chondrocyte differentiation
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0060164	regulation of timing of neuron differentiation
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046982	protein heterodimerization activity
GO:0003700	transcription factor activity

SRY-box containing gene 5

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function