SRY-box containing gene 6

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同義遺伝子名

SRY-box containing gene 6, Transcription factor SOX-6, SOX-LZ, Sox-6, Sox6, AI987981

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:50.40

小脳:92.10

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:95.50

脊柱:141.90

網膜:-

目:53.20

動脈:421.90

静脈:-

リンパ節:32.40

末梢血:14.40

脾臓:52.70

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:50.10

皮膚:71.30

GeneChip

大脳:4.72

小脳:4.65

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:4.53

脊柱:4.66

網膜:4.43

目:4.49

動脈:-

静脈:5.27

リンパ節:4.12

末梢血:-

脾臓:4.55

胸腺:-

骨髄:8.67

脂肪:6.44

骨:7.01

皮膚:5.13

CAGE

大脳:2.01

小脳:-

脳幹:2.21

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:2.73

網膜:-

目:-

動脈:2.24

静脈:-

リンパ節:0.23

末梢血:-

脾臓:5.10

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:-

骨:4.57

皮膚:2.62

RNA-seq

大脳:1.55

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:55.20

前立腺:-

卵巣:-

精巣:88.70

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:36.20

肺:10

膀胱:-

腎臓:48.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:9.40

乳腺:26.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.22

胎盤:4.69

前立腺:4.15

卵巣:4.56

精巣:9.54

心臓:4.97

骨格筋:8.21

食道:-

胃:4.50

腸:4.99

結腸:-

肝臓:4.98

肺:4.18

膀胱:4.47

腎臓:6.05

下垂体:4.27

甲状腺:-

副腎:4.59

膵臓:4.88

乳腺:5.65

唾液腺:4.04

CAGE

子宮:0.74

胎盤:0.56

前立腺:0.37

卵巣:1.14

精巣:0.45

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:1.07

腸:0.42

結腸:0.70

肝臓:0.47

肺:1.05

膀胱:1.31

腎臓:-

下垂体:1.31

甲状腺:-

副腎:0.78

膵臓:0

乳腺:0.30

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:4.78

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:1.85

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001025559
Gene ID	20679
Unigene ID	Mm.323365
Probe set ID	1426018_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000051910

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]	NM_001145811, NM_001145819, NM_017508, NM_033326
ラット[1]	NM_001024751, NM_001145819, NM_017508, NM_033326

染色体

7F1 [122,614,858 - 123,182,258]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910	High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071	High mobility group, superfamily

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0048708	astrocyte differentiation
GO:0035051	cardiac cell differentiation
GO:0051216	cartilage development
GO:0045165	cell fate commitment
GO:0000902	cell morphogenesis
GO:0048821	erythrocyte development
GO:0030218	erythrocyte differentiation
GO:0016458	gene silencing
GO:0030097	hemopoiesis
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0042692	muscle cell differentiation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0021778	oligodendrocyte cell fate specification
GO:0048709	oligodendrocyte differentiation
GO:0032332	positive regulation of chondrocyte differentiation
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0009791	post-embryonic development
GO:0010468	regulation of gene expression
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046982	protein heterodimerization activity
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity

SRY-box containing gene 6

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function