tripartite motif-containing 21

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同義遺伝子名

52 kDa ribonucleoprotein autoantigen Ro/SS-A, Trim21, Ssa1, 52 kDa Ro protein, Ro52, SS-A, Sjoegren syndrome type A antigen, Tripartite motif-containing protein 21, tripartite motif protein 21, Ro(SS-A)

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:168.80 静脈:- リンパ節:162 末梢血:28.80 脾臓:158 胸腺:98.80 骨髄:115.40 脂肪:- 骨:25 皮膚:15.80
GeneChip 大脳:6.07 小脳:5.86 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.06 脊柱:6.29 網膜:7.35 目:7.86 動脈:- 静脈:7.21 リンパ節:9.61 末梢血:- 脾臓:9.44 胸腺:- 骨髄:8.65 脂肪:7.87 骨:8.43 皮膚:7.56
CAGE 大脳:0.81 小脳:- 脳幹:1.27 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:0.91 網膜:- 目:- 動脈:2.36 静脈:- リンパ節:3.34 末梢血:- 脾臓:2.49 胸腺:3.07 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.72 皮膚:2.21
RNA-seq 大脳:0.93 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:27.60 前立腺:- 卵巣:11.50 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:40.20    膀胱:198.50 腎臓:24.20 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:18.80 乳腺:29.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.07 胎盤:7.47 前立腺:7.63 卵巣:7.64 精巣:5.94 心臓:7.52 骨格筋:7.01 食道:- 胃:7.24 腸:7.83 結腸:- 肝臓:7.66 肺:8.54 膀胱:7.59 腎臓:7.38 下垂体:8.32 甲状腺:- 副腎:7.80 膵臓:6.98 乳腺:8.76 唾液腺:7.80
CAGE 子宮:2.42 胎盤:1.96 前立腺:2.17 卵巣:2.13 精巣:0.45 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.07 腸:2.27 結腸:2.39     肝臓:2.29    肺:2.78 膀胱:2.27 腎臓:- 下垂体:2.73 甲状腺:- 副腎:2.51 膵臓:2.03 乳腺:2.66 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.23 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.55        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_009277
Gene ID 20821
Unigene ID Mm.321227
Probe set ID 1448940_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000030966

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_003141
ラット[1]  NM_001082572

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001870  B302 (SPRY)-like
IPR003879  Butyrophylin-like
IPR003877  SPla/RYanodine receptor SPRY
IPR018355  SPla/RYanodine receptor subgroup
IPR000315  Zinc finger, B-box
IPR020457  Zinc finger, B-box, chordata

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8625517
10349636
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23222971
23455675
23596308
23840060
24567374

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007049  cell cycle
GO:0032088  negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
GO:0090086  negative regulation of protein deubiquitination
GO:0045787  positive regulation of cell cycle
GO:0051865  protein autoubiquitination
GO:0031648  protein destabilization
GO:0006513  protein monoubiquitination
GO:0000209  protein polyubiquitination
GO:0070206  protein trimerization
GO:0016567  protein ubiquitination

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005622  intracellular
GO:0005634  nucleus
GO:0030529  ribonucleoprotein complex
GO:0019005  SCF ubiquitin ligase complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0016874  ligase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270  zinc ion binding