structure specific recognition protein 1

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同義遺伝子名

Structure-specific recognition protein 1, structure specific recognition protein 1, Hmgox, T160, Hmg1-rs1, C81323, FACT complex subunit SSRP1, Ssrp1, Hmgi-rs3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:208.40 小脳:18.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:95.50 脊柱:94.60 網膜:289.30 目:235.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:54 末梢血:474.40 脾臓:65.80 胸腺:128.40 骨髄:282.10 脂肪:- 骨:225.40 皮膚:190
GeneChip 大脳:8.83 小脳:8.86 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.50 脊柱:8.28 網膜:8.96 目:8.80 動脈:- 静脈:9.49 リンパ節:9.72 末梢血:- 脾臓:9.89 胸腺:- 骨髄:10.57 脂肪:8.67 骨:10.57 皮膚:9.18
CAGE 大脳:3.59 小脳:- 脳幹:3.39 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.28 網膜:- 目:- 動脈:2.94 静脈:- リンパ節:3.45 末梢血:- 脾臓:4.04 胸腺:3.81 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.94 皮膚:3.10
RNA-seq 大脳:11.27 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:130.90 胎盤:96.70 前立腺:- 卵巣:103.40 精巣:118.20 心臓:148.80 骨格筋:71 食道:- 胃:163.60 腸:- 結腸:-     肝臓:90.50        肺:90.40    膀胱:- 腎臓:153.10 下垂体:477.90 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:168.90 乳腺:205.70 唾液腺:54
GeneChip 子宮:9.65 胎盤:8.73 前立腺:9.07 卵巣:9.61 精巣:9.06 心臓:8.31 骨格筋:8.15 食道:- 胃:8.89 腸:9.20 結腸:- 肝臓:8.65 肺:8.97 膀胱:8.87 腎臓:8.60 下垂体:9.56 甲状腺:- 副腎:8.94 膵臓:8.92 乳腺:9.04 唾液腺:9.34
CAGE 子宮:3.72 胎盤:3.50 前立腺:3.30 卵巣:3.53 精巣:4.59 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.32 腸:3.34 結腸:3.18     肝臓:3.20    肺:3.46 膀胱:3.22 腎臓:- 下垂体:3.74 甲状腺:- 副腎:3.44 膵臓:2.83 乳腺:3.37 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:4.11 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:7.75        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_182990
Gene ID 20833
Unigene ID Mm.219793
Probe set ID 1426789_s_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000027067

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_003146
ラット [0]  

染色体

2D  [84,877,355  -  84,887,266]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR000135  High mobility group, HMG1/HMG2, subgroup
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1678855
8093609
8268661
9300827
9367632
9885975
10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
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12477932
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15489334
15618518
15782199
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16141073
17967808
18287559
18799693
20059953
20362542
20412781
20932939
21589869
21677750
22083510
22252316
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008150  biological_process
GO:0006281  DNA repair
GO:0006260  DNA replication
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005694  chromosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding