alkB, alkylation repair homolog 1 (E. coli)

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同義遺伝子名

Alkbh, 2700073G19Rik, alkB, hABH, Alkbh1, alkB, alkylation repair homolog 1 (E. coli)

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:12.20 小脳:18.40 脳幹:63.60 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:47.30 網膜:32.10 目:38 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:28.80 脾臓:13.20 胸腺:59.30 骨髄:- 脂肪:- 骨:25 皮膚:23.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.77 小脳:- 脳幹:2.45 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.51 網膜:- 目:- 動脈:2.79 静脈:- リンパ節:4.16 末梢血:- 脾臓:3.21 胸腺:3.36 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.97 皮膚:3.49
RNA-seq 大脳:1.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:34.50 精巣:81.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:9.10        肺:40.20    膀胱:66.20 腎臓:24.20 下垂体:38.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:75.10 乳腺:19.60 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.46 胎盤:2.62 前立腺:2.54 卵巣:3.32 精巣:2.85 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.36 腸:2.67 結腸:2.71     肝臓:2.87    肺:2.74 膀胱:2.64 腎臓:- 下垂体:3.44 甲状腺:- 副腎:2.98 膵臓:2.83 乳腺:3.31 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.20 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.39        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001102565
Gene ID 211064
Unigene ID Mm.26840
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000079036

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_006020
ラット[1]  NM_001108718

染色体

12D2  [88,767,119  -  88,784,789]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
16141072
16141073
16860792
18163532
18799693
19468303
21072209
21267068
22961808
22965116
23825659

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030154  cell differentiation
GO:0048589  developmental growth
GO:0006307  DNA dealkylation
GO:0080111  DNA demethylation
GO:0006281  DNA repair
GO:0001701  in utero embryonic development
GO:0008152  metabolic process
GO:0043524  negative regulation of neuron apoptosis
GO:0001764  neuron migration
GO:0031175  neuron projection development
GO:0055114  oxidation reduction
GO:0070989  oxidative demethylation
GO:0001890  placenta development
GO:0050918  positive chemotaxis
GO:0010468  regulation of gene expression
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0042245  RNA repair

Cellular Component

GO:0005739  mitochondrion
GO:0005719  nuclear euchromatin
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003824  catalytic activity
GO:0042056  chemoattractant activity
GO:0003906  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase activity
GO:0008198  ferrous iron binding
GO:0016829  lyase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0070579  methylcytosine dioxygenase activity
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0005515  protein binding