PR domain containing 9

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同義遺伝子名

Meisetz, Prdm9, BC012016, VPR domain containing 9, MGC21428

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:1.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:96.40 目:22.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:14.40 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.46 小脳:4.67 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:4.71 脊柱:4.69 網膜:4.75 目:4.81 動脈:- 静脈:4.68 リンパ節:5.14 末梢血:- 脾臓:5.17 胸腺:- 骨髄:4.95 脂肪:4.98 骨:4.70 皮膚:5.19
CAGE 大脳:1.88 小脳:- 脳幹:1.91 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.09 網膜:- 目:- 動脈:2.94 静脈:- リンパ節:3.24 末梢血:- 脾臓:1.89 胸腺:1.43 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.69 皮膚:2.93
RNA-seq 大脳:0.60 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:41.40 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:6.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.66 胎盤:5.80 前立腺:4.47 卵巣:4.66 精巣:5.13 心臓:5.05 骨格筋:5.04 食道:- 胃:5.57 腸:4.92 結腸:- 肝臓:5.23 肺:4.74 膀胱:4.97 腎臓:4.89 下垂体:4.73 甲状腺:- 副腎:4.56 膵臓:5.49 乳腺:4.82 唾液腺:5.17
CAGE 子宮:1.65 胎盤:1.61 前立腺:1.56 卵巣:1.83 精巣:1.97 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.67 腸:2.33 結腸:2.42     肝臓:2.43    肺:1.93 膀胱:1.92 腎臓:- 下垂体:1.40 甲状腺:- 副腎:1.82 膵臓:2.66 乳腺:2.21 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.07 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.63        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_144809
Gene ID 213389
Unigene ID Mm.215162
Probe set ID 1426107_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000051977

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001098173, NM_052996
ラット[2]  NM_001098173, NM_052996

染色体

17A2  [15,680,043  -  15,701,318]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001909  Krueppel-associated box
IPR003655  Krueppel-associated box-related
IPR015880  Zinc finger, C2H2-like
IPR007087  Zinc finger, C2H2-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
14610273
16292313
18245833
19050759
19074312
19226188
19226189
20044538
20044539
21267068
21460839
21677750
21917142
22028627
22258617
22448252
22660327
23133405

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0051568  histone H3-K4 methylation
GO:0034968  histone lysine methylation
GO:0016571  histone methylation
GO:0007126  meiosis
GO:0006311  meiotic gene conversion
GO:0032259  methylation
GO:0018022  peptidyl-lysine methylation
GO:0060903  positive regulation of meiosis I
GO:0010845  positive regulation of reciprocal meiotic recombination
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007283  spermatogenesis
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005694  chromosome
GO:0005622  intracellular
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0042800  histone methyltransferase activity (H3-K4 specific)
GO:0018024  histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0008168  methyltransferase activity
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0010844  recombination hotspot binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0016740  transferase activity