thymine DNA glycosylase

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同義遺伝子名

Jza1, JZA-3, thymine DNA glycosylase, Tdg, E130317C12Rik, C-JUN leucine zipper interactive protein JZA-3, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:6.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:19.10 脊柱:- 網膜:32.10 目:7.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:43.10 脾臓:13.20 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:112.70 皮膚:15.80
GeneChip 大脳:8.38 小脳:8.48 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.90 脊柱:7.48 網膜:9.97 目:9.94 動脈:- 静脈:9.22 リンパ節:8.36 末梢血:- 脾臓:8.12 胸腺:- 骨髄:9.10 脂肪:8.30 骨:9.40 皮膚:9.35
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:2.26 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:69 前立腺:- 卵巣:11.50 精巣:14.80 心臓:37.20 骨格筋:35.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:36.20        肺:30.10    膀胱:- 腎臓:8.10 下垂体:193.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:93.80 乳腺:84.90 唾液腺:54
GeneChip 子宮:8.51 胎盤:9.45 前立腺:8.51 卵巣:8.42 精巣:6.57 心臓:7.71 骨格筋:7.93 食道:- 胃:8.54 腸:9 結腸:- 肝臓:8.07 肺:8.01 膀胱:8 腎臓:8.11 下垂体:8.36 甲状腺:- 副腎:8.74 膵臓:8.22 乳腺:8.54 唾液腺:8.70
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.58 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.90        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_011561
Gene ID 21665
Unigene ID Mm.284252
Probe set ID 1416790_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000034674

オーソログ対応遺伝子

ヒト [0]  
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003310  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase
IPR005122  Uracil-DNA glycosylase-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1631061
8662714
8995763
9694815
9794235
10349636
10922068
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11076861
11217851
11864601
12466851
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15569683
15782199
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16141073
16282588
17060459
17175537
18452947
18799693
18945672
19402749
19966277
20595612
21267068
21278727
21677750
21722948
21745813
21817016
22200605

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006284  base-excision repair
GO:0016568  chromatin modification
GO:0080111  DNA demethylation
GO:0006281  DNA repair
GO:0009790  embryonic development
GO:0008152  metabolic process
GO:0006298  mismatch repair
GO:0032091  negative regulation of protein binding
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0040029  regulation of gene expression, epigenetic
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0016605  PML body

Molecular Function

GO:0019104  DNA N-glycosylase activity
GO:0003690  double-stranded DNA binding
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016798  hydrolase activity, acting on glycosyl bonds
GO:0016799  hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds
GO:0030983  mismatched DNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0019904  protein domain specific binding
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0005080  protein kinase C binding
GO:0008263  pyrimidine-specific mismatch base pair DNA N-glycosylase activity
GO:0043566  structure-specific DNA binding
GO:0032183  SUMO binding
GO:0008134  transcription factor binding