thymine DNA glycosylase

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

Jza1, JZA-3, thymine DNA glycosylase, Tdg, E130317C12Rik, C-JUN leucine zipper interactive protein JZA-3, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:6.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:19.10 脊柱:- 網膜:32.10 目:7.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:43.10 脾臓:13.20 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:112.70 皮膚:15.80
GeneChip 大脳:8.57 小脳:8.64 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.09 脊柱:7.60 網膜:9.71 目:9.69 動脈:- 静脈:9.25 リンパ節:8.67 末梢血:- 脾臓:8.41 胸腺:- 骨髄:9.31 脂肪:8.17 骨:9.58 皮膚:9.54
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:2.26 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:69 前立腺:- 卵巣:11.50 精巣:14.80 心臓:37.20 骨格筋:35.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:36.20        肺:30.10    膀胱:- 腎臓:8.10 下垂体:193.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:93.80 乳腺:84.90 唾液腺:54
GeneChip 子宮:8.90 胎盤:9.30 前立腺:8.74 卵巣:8.83 精巣:6.45 心臓:7.59 骨格筋:8.35 食道:- 胃:8.71 腸:9.28 結腸:- 肝臓:8.21 肺:8.12 膀胱:8.35 腎臓:8.17 下垂体:8.49 甲状腺:- 副腎:8.91 膵臓:8.18 乳腺:8.83 唾液腺:8.89
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.58 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.90        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_172552
Gene ID 21665
Unigene ID Mm.284252
Probe set ID 1435715_x_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000034674

オーソログ対応遺伝子

ヒト [0]  
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003310  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase
IPR005122  Uracil-DNA glycosylase-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1631061
8662714
8995763
9694815
9794235
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
11864601
12466851
12477932
12904583
15569683
15782199
16141072
16141073
16282588
17060459
17175537
18452947
18799693
18945672
19402749
19966277
20595612
21267068
21278727
21677750
21722948
21745813
21817016
22200605

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006284  base-excision repair
GO:0016568  chromatin modification
GO:0080111  DNA demethylation
GO:0006281  DNA repair
GO:0009790  embryonic development
GO:0008152  metabolic process
GO:0006298  mismatch repair
GO:0032091  negative regulation of protein binding
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0040029  regulation of gene expression, epigenetic
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0016605  PML body

Molecular Function

GO:0019104  DNA N-glycosylase activity
GO:0003690  double-stranded DNA binding
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016798  hydrolase activity, acting on glycosyl bonds
GO:0016799  hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds
GO:0030983  mismatched DNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0019904  protein domain specific binding
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0005080  protein kinase C binding
GO:0008263  pyrimidine-specific mismatch base pair DNA N-glycosylase activity
GO:0043566  structure-specific DNA binding
GO:0032183  SUMO binding
GO:0008134  transcription factor binding