trinucleotide repeat containing 6C

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同義遺伝子名

mKIAA1582, Tnrc6c, trinucleotide repeat containing 6C, 9930033H14Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:9.01 小脳:8.90 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.07 脊柱:8.30 網膜:9.23 目:8.70 動脈:- 静脈:8.52 リンパ節:8.93 末梢血:- 脾臓:9.17 胸腺:- 骨髄:8.51 脂肪:7.97 骨:8.67 皮膚:9.48
CAGE 大脳:4.25 小脳:- 脳幹:3.63 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.50 網膜:- 目:- 動脈:3.80 静脈:- リンパ節:4.14 末梢血:- 脾臓:3.74 胸腺:4.47 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.99 皮膚:4.63
RNA-seq 大脳:4.62 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:9.04 胎盤:7.75 前立腺:8.40 卵巣:8.52 精巣:8.31 心臓:8.45 骨格筋:8.59 食道:- 胃:8.07 腸:8.20 結腸:- 肝臓:7.42 肺:8.34 膀胱:8.39 腎臓:8.08 下垂体:9.24 甲状腺:- 副腎:9.25 膵臓:7.62 乳腺:8.33 唾液腺:8.37
CAGE 子宮:3.76 胎盤:3.07 前立腺:3.38 卵巣:3.62 精巣:4.66 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.79 腸:3.06 結腸:3.31     肝臓:3.16    肺:3.87 膀胱:3.60 腎臓:- 下垂体:4.08 甲状腺:- 副腎:3.63 膵臓:3.80 乳腺:3.34 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.81 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.04        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_198022
Gene ID 217351
Unigene ID -
Probe set ID 1424645_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000025571

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001142640, NM_018996
ラット[2]  NM_001142640, NM_018996

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000449  Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal
IPR015940  Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12693553
12904583
14610273
16033648
16141072
16141073
17967808
18799693
19838187
21267068
22187428

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0035162  embryonic hemopoiesis
GO:0048568  embryonic organ development
GO:0007492  endoderm development
GO:0001706  endoderm formation
GO:0031047  gene silencing by RNA
GO:0060213  positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0060964  regulation of gene silencing by miRNA
GO:0006417  regulation of translation

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component

Molecular Function

GO:0003674  molecular_function
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0003723  RNA binding