lysine (K)-specific demethylase 1B

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同義遺伝子名

MGC38211, amine oxidase, flavin containing 1, 4632428N09Rik, AI482520, Aof1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.78 小脳:- 脳幹:1.75 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.09 網膜:- 目:- 動脈:2.55 静脈:- リンパ節:2.62 末梢血:- 脾臓:2.16 胸腺:3.28 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.66 皮膚:2.82
RNA-seq 大脳:1.04 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.57 胎盤:2.92 前立腺:3.62 卵巣:2.56 精巣:1.71 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.39 腸:2.73 結腸:3.10     肝臓:3.24    肺:2.67 膀胱:4.60 腎臓:- 下垂体:2.75 甲状腺:- 副腎:2.04 膵臓:4.36 乳腺:2.59 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.33 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.64        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_172262
Gene ID 218214
Unigene ID -
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000038080

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_153042
ラット[1]  NM_001107343

染色体

13A5  [47,138,868  -  47,179,982]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003042  Aromatic-ring hydroxylase-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11076861
11217851
11544199
12466851
12477932
14681479
15489334
16141072
16141073
19407342
19727073
20101264
21267068
21677750
22878500
22951486

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0043046  DNA methylation during gametogenesis
GO:0006349  genetic imprinting
GO:0034720  histone H3-K4 demethylation
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0055114  oxidation reduction
GO:0044030  regulation of DNA methylation
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0050660  FAD binding
GO:0034648  histone demethylase activity (H3-dimethyl-K4 specific)
GO:0034649  histone demethylase activity (H3-monomethyl-K4 specific)
GO:0034647  histone demethylase activity (H3-trimethyl-K4 specific)
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0008270  zinc ion binding