triple functional domain (PTPRF interacting)

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同義遺伝子名

6720464I07Rik, Trio, AA408740, triple functional domain (PTPRF interacting), Solo

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:9.10 小脳:9.38 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.55 脊柱:8.38 網膜:8.50 目:8.35 動脈:- 静脈:9.31 リンパ節:8.07 末梢血:- 脾臓:7.74 胸腺:- 骨髄:7.10 脂肪:7.89 骨:7.17 皮膚:8.21
CAGE 大脳:4.35 小脳:- 脳幹:3.60 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.46 網膜:- 目:- 動脈:3.12 静脈:- リンパ節:2.14 末梢血:- 脾臓:2.26 胸腺:2.19 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.97 皮膚:3.50
RNA-seq 大脳:8.52 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:9.23 胎盤:8.46 前立腺:8.20 卵巣:9.04 精巣:6.96 心臓:8.31 骨格筋:8.32 食道:- 胃:7.57 腸:7.80 結腸:- 肝臓:7.04 肺:8.13 膀胱:8.70 腎臓:8.16 下垂体:8.62 甲状腺:- 副腎:8.31 膵臓:7.16 乳腺:8.17 唾液腺:7.45
CAGE 子宮:3.41 胎盤:3.44 前立腺:2.69 卵巣:3.53 精巣:0.99 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.91 腸:2.38 結腸:2.78     肝臓:2.66    肺:3.35 膀胱:3.49 腎臓:- 下垂体:3.56 甲状腺:- 副腎:3.39 膵臓:2.83 乳腺:3.03 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:5.29 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.87        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001081302
Gene ID 223435
Unigene ID -
Probe set ID 1454711_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000022263

オーソログ対応遺伝子

ヒト[5]  NM_007118
ラット[5]  NM_007118

染色体

15B1  [27,660,407  -  27,955,603]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001849  Pleckstrin homology
IPR000719  Protein kinase, catalytic domain
IPR011009  Protein kinase-like domain
IPR002290  Serine/threonine-protein kinase domain
IPR017442  Serine/threonine-protein kinase-like domain
IPR018159  Spectrin/alpha-actinin
IPR001245  Tyrosine-protein kinase, catalytic domain
IPR020635  Tyrosine-protein kinase, subgroup, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11050238
11076861
11217851
12466851
12477932
12904583
15489334
15715966
16141072
16141073
16602821
16914736
16943433
17332503
17898204
18212043
18799693
20516067
21267068
22031541
23177739
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016310  phosphorylation
GO:0006468  protein amino acid phosphorylation
GO:0035023  regulation of Rho protein signal transduction

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0005085  guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0016301  kinase activity
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005543  phospholipid binding
GO:0004672  protein kinase activity
GO:0004674  protein serine/threonine kinase activity
GO:0005089  Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0016740  transferase activity
GO:0016772  transferase activity, transferring phosphorus-containing groups