CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1

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同義遺伝子名

Nliif, Nuclear LIM interactor-interacting factor 3, NLIIF, Ctdsp1, Nif3, GIP, NLI-interacting factor 3, Golli-interacting protein

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.85 小脳:8.09 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.10 脊柱:8.85 網膜:8.62 目:9.41 動脈:- 静脈:9.60 リンパ節:9.81 末梢血:- 脾臓:9.97 胸腺:- 骨髄:9.94 脂肪:9.63 骨:9.73 皮膚:9.50
CAGE 大脳:3.17 小脳:- 脳幹:3.27 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.39 網膜:- 目:- 動脈:4.49 静脈:- リンパ節:3.44 末梢血:- 脾臓:4.10 胸腺:3.74 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.30 皮膚:3.86
RNA-seq 大脳:9.60 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:10.47 胎盤:8.96 前立腺:9.93 卵巣:10.14 精巣:8.14 心臓:10.16 骨格筋:10.22 食道:- 胃:9.91 腸:9.86 結腸:- 肝臓:10.50 肺:10.37 膀胱:9.76 腎臓:10.07 下垂体:9.10 甲状腺:- 副腎:9.64 膵臓:9.29 乳腺:9.62 唾液腺:9.79
CAGE 子宮:4.46 胎盤:4.11 前立腺:3.94 卵巣:4.25 精巣:2.79 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:4.88 腸:4.45 結腸:4.76     肝臓:4.91    肺:4.48 膀胱:4.42 腎臓:- 下垂体:3.56 甲状腺:- 副腎:4.42 膵臓:4.23 乳腺:4.01 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:10.40 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:15.36        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_153088
Gene ID 227292
Unigene ID -
Probe set ID 1452055_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000026176

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_001206878, NM_001206879, NM_021198, NM_182642
ラット[2]  NM_001128079, NM_001206879, NM_021198, NM_182642

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011948  Dullard-like phosphatase domain
IPR004274  NLI interacting factor

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8632996
8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14743429
15489334
15618518
15747579
15782199
16141072
16141073
17403776
18287559
18625321
18799693
20412781
21239611
21677750
22210897

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0050768  negative regulation of neurogenesis
GO:0045665  negative regulation of neuron differentiation
GO:0006470  protein amino acid dephosphorylation
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0008420  CTD phosphatase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016791  phosphatase activity
GO:0004721  phosphoprotein phosphatase activity