spastic paraplegia 20, spartin (Troyer syndrome) homolog (human)

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

AI840044, TAHCCP1, Kiaa0610, MGC28621, SPARTIN, Spg20, Spartin, mKIAA0610, C79168

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:86.80 小脳:36.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:76.40 脊柱:47.30 網膜:128.60 目:91.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.80 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:59.30 骨髄:38.50 脂肪:- 骨:175.30 皮膚:245.40
GeneChip 大脳:8.76 小脳:8.76 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.33 脊柱:10.14 網膜:8.83 目:9.17 動脈:- 静脈:9.43 リンパ節:8.20 末梢血:- 脾臓:7.95 胸腺:- 骨髄:7.53 脂肪:8.56 骨:7.95 皮膚:9.09
CAGE 大脳:3.19 小脳:- 脳幹:3.70 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.98 網膜:- 目:- 動脈:2.94 静脈:- リンパ節:2.50 末梢血:- 脾臓:2.12 胸腺:2.29 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.45 皮膚:3.41
RNA-seq 大脳:5.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:124.30 前立腺:- 卵巣:551.60 精巣:36.90 心臓:18.60 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:63.40        肺:70.30    膀胱:- 腎臓:56.40 下垂体:361.70 甲状腺:- 副腎:424.40 膵臓:37.50 乳腺:65.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.60 胎盤:9.39 前立腺:8.79 卵巣:8.69 精巣:8.01 心臓:8.94 骨格筋:9.15 食道:- 胃:8.23 腸:8.13 結腸:- 肝臓:9.28 肺:8.79 膀胱:8.61 腎臓:8.44 下垂体:10.32 甲状腺:- 副腎:8.77 膵臓:9.28 乳腺:9.06 唾液腺:8.80
CAGE 子宮:2.61 胎盤:3.01 前立腺:3.23 卵巣:2.78 精巣:2.82 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.75 腸:3.35 結腸:2.85     肝臓:3.21    肺:3.02 膀胱:2.80 腎臓:- 下垂体:3.91 甲状腺:- 副腎:2.90 膵臓:4.11 乳腺:3.13 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:3.08 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:4.48        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_144895
Gene ID 229285
Unigene ID Mm.235523
Probe set ID 1451520_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000036580

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_001142294, NM_001142295, NM_001142296, NM_015087
ラット[1]  NM_001106433, NM_001142295, NM_001142296, NM_015087

染色体

3C  [54,916,030  -  54,941,244]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
14621295
15489334
15782199
16036216
16141072
16141073
16602821
21267068
21559443
21707618
22619377
22982304

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009838  abscission
GO:0060612  adipose tissue development
GO:0051301  cell division
GO:0000910  cytokinesis
GO:0034389  lipid particle organization
GO:0030514  negative regulation of BMP signaling pathway
GO:0048698  negative regulation of collateral sprouting in the absence of injury
GO:0050905  neuromuscular process
GO:0051881  regulation of mitochondrial membrane potential

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005811  lipid particle
GO:0030496  midbody
GO:0005741  mitochondrial outer membrane
GO:0045202  synapse

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0031625  ubiquitin protein ligase binding