TAR DNA binding protein

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同義遺伝子名

TDP-43, TAR DNA binding protein, Tdp43, 1190002A23Rik, Tardbp, C85084, TAR DNA-binding protein 43

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:243.10

小脳:55.30

脳幹:222.50

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:305.70

脊柱:-

網膜:610.70

目:417.90

動脈:84.40

静脈:-

リンパ節:32.40

末梢血:230

脾臓:171.20

胸腺:503.90

骨髄:25.60

脂肪:-

骨:288.10

皮膚:245.40

GeneChip

大脳:8.94

小脳:9.22

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:8.89

脊柱:8.51

網膜:7.84

目:7.59

動脈:-

静脈:9.63

リンパ節:10.45

末梢血:-

脾臓:10.24

胸腺:-

骨髄:10.70

脂肪:9.35

骨:10.33

皮膚:9.59

CAGE

大脳:4.33

小脳:-

脳幹:4.21

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:3.97

網膜:-

目:-

動脈:3.93

静脈:-

リンパ節:4.77

末梢血:-

脾臓:4.34

胸腺:4.77

骨髄:-

脂肪:-

骨:4.57

皮膚:4.46

RNA-seq

大脳:7.69

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:479.90

胎盤:372.80

前立腺:277.90

卵巣:298.80

精巣:317.80

心臓:260.40

骨格筋:71

食道:-

胃:687.30

腸:221.80

結腸:334.80

肝臓:99.60

肺:210.90

膀胱:-

腎臓:185.40

下垂体:413.40

甲状腺:224.90

副腎:-

膵臓:394.10

乳腺:254.70

唾液腺:54

GeneChip

子宮:9.98

胎盤:9.62

前立腺:9.51

卵巣:9.90

精巣:8.47

心臓:8.66

骨格筋:9.07

食道:-

胃:9.53

腸:9.88

結腸:-

肝臓:9.30

肺:9.71

膀胱:9.58

腎臓:9.37

下垂体:9.56

甲状腺:-

副腎:9.17

膵臓:9.18

乳腺:9.63

唾液腺:9.17

CAGE

子宮:4.17

胎盤:4.35

前立腺:4.10

卵巣:4.18

精巣:4.13

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:4.03

腸:3.94

結腸:4.06

肝臓:3.86

肺:4.20

膀胱:4.05

腎臓:-

下垂体:4.43

甲状腺:-

副腎:3.98

膵臓:4.23

乳腺:4.43

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:6.13

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:4.69

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_145556
Gene ID	230908
Unigene ID	Mm.22453
Probe set ID	1455655_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000041459

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]	NM_007375
ラット[4]	NM_007375

染色体

4E2 [147,986,491 - 148,001,128]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0070935	3'-UTR-mediated mRNA stabilization
GO:0006397	mRNA processing
GO:0043922	negative regulation by host of viral transcription
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0008380	RNA splicing
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0003730	mRNA 3'-UTR binding
GO:0003676	nucleic acid binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

TAR DNA binding protein

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function