slingshot homolog 1 (Drosophila)

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同義遺伝子名

AW551225, Ssh1l, Ssh1, mSSH-1L, Kiaa1298, SSH-1, Gm1394, SSH-1L, slingshot homolog 1 (Drosophila), Gm1395, Protein phosphatase Slingshot homolog 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:29.50 小脳:36.80 脳幹:95.30 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:38.20 脊柱:189.10 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:486.10 末梢血:28.80 脾臓:184.30 胸腺:- 骨髄:12.80 脂肪:212.70 骨:50.10 皮膚:31.70
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.23 小脳:- 脳幹:2.18 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.42 網膜:- 目:- 動脈:2.62 静脈:- リンパ節:2.77 末梢血:- 脾臓:3.34 胸腺:1.57 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.83 皮膚:1.46
RNA-seq 大脳:1.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:174.50 胎盤:41.40 前立腺:- 卵巣:23 精巣:22.20 心臓:18.60 骨格筋:- 食道:- 胃:196.40 腸:- 結腸:-     肝臓:18.10        肺:40.20    膀胱:- 腎臓:24.20 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:424.40 膵臓:46.90 乳腺:6.50 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.56 胎盤:2.70 前立腺:2.19 卵巣:2.42 精巣:0.99 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.75 腸:2.06 結腸:2.64     肝臓:2.13    肺:2.88 膀胱:2.76 腎臓:- 下垂体:2.39 甲状腺:- 副腎:2.51 膵臓:1.84 乳腺:1.21 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.58 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.46        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_198109
Gene ID 231637
Unigene ID Mm.389682
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000042121

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_001161330, NM_001161331, NM_018984
ラット[4]  NM_001161330, NM_001161331, NM_018984

染色体

5F  [114,387,103  -  114,443,903]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000340  Dual specificity phosphatase, catalytic domain
IPR020422  Dual specificity phosphatase, subgroup, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
14531860
14610273
15368895
15489334
15660133
15782199
16141072
16141073
17535256
18799693
19000834
21267068
21677750
21857021
22282498

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030036  actin cytoskeleton organization
GO:0000902  cell morphogenesis
GO:0071318  cellular response to ATP
GO:0016311  dephosphorylation
GO:0006470  protein amino acid dephosphorylation
GO:0008064  regulation of actin polymerization or depolymerization
GO:0050770  regulation of axonogenesis
GO:0032268  regulation of cellular protein metabolic process
GO:0010591  regulation of lamellipodium assembly

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016791  phosphatase activity
GO:0004721  phosphoprotein phosphatase activity
GO:0004725  protein tyrosine phosphatase activity
GO:0008138  protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity