histone deacetylase 11

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同義遺伝子名

HD11, histone deacetylase 11, Histone deacetylase 11, MGC27683, Hdac11

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:208.40 小脳:184.20 脳幹:222.50 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:378.30 網膜:64.30 目:60.80 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:- 末梢血:28.80 脾臓:- 胸腺:19.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.50 皮膚:63.30
GeneChip 大脳:9.21 小脳:8.67 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.50 脊柱:9.64 網膜:10.50 目:9.74 動脈:- 静脈:6.43 リンパ節:6 末梢血:- 脾臓:7.26 胸腺:- 骨髄:6.20 脂肪:7.33 骨:6.18 皮膚:7.14
CAGE 大脳:4.07 小脳:- 脳幹:4.68 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.60 網膜:- 目:- 動脈:1.20 静脈:- リンパ節:1.47 末梢血:- 脾臓:1.36 胸腺:1.17 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.97 皮膚:2.17
RNA-seq 大脳:40.93 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:11.50 精巣:7.40 心臓:18.60 骨格筋:- 食道:- 胃:32.70 腸:37 結腸:17.60     肝臓:81.50        肺:70.30    膀胱:66.20 腎臓:- 下垂体:90.40 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:28.10 乳腺:49 唾液腺:162
GeneChip 子宮:7.21 胎盤:7.11 前立腺:8.39 卵巣:7.44 精巣:8.85 心臓:7.42 骨格筋:6.68 食道:- 胃:7.38 腸:7.32 結腸:- 肝臓:8.08 肺:6.49 膀胱:7.22 腎臓:7.51 下垂体:8.61 甲状腺:- 副腎:7.07 膵臓:8.14 乳腺:7.28 唾液腺:7.86
CAGE 子宮:2.42 胎盤:0.44 前立腺:2.79 卵巣:2.54 精巣:3.98 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.13 腸:2.49 結腸:2.74     肝臓:3.39    肺:2.33 膀胱:2.68 腎臓:- 下垂体:3.98 甲状腺:- 副腎:2.26 膵臓:3.80 乳腺:1.72 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.18 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:7.18        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_144919
Gene ID 232232
Unigene ID Mm.206218
Probe set ID 1454803_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000034245

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001136041, NM_024827
ラット[1]  NM_001106610, NM_024827

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000286  Histone deacetylase superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
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12477932
12711221
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15489334
15782199
16141072
16141073
16602821
17568773
17893925
18824292
19011628
20059953
21677750
21731673
21985497
23657855
24047695
24726361
24747960

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0016575  histone deacetylation
GO:0070932  histone H3 deacetylation
GO:0070933  histone H4 deacetylation
GO:0014003  oligodendrocyte development
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0000118  histone deacetylase complex
GO:0005634  nucleus
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0004407  histone deacetylase activity
GO:0031078  histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0034739  histone deacetylase activity (H3-K16 specific)
GO:0032129  histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0032041  NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969  NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970  NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0005515  protein binding
GO:0008134  transcription factor binding