synemin, intermediate filament protein

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同義遺伝子名

MGC56976, E130104F11, desmuslin, AI852401, Dmn, 4930412K21Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:12.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:38.20 脊柱:- 網膜:- 目:53.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:19.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:25 皮膚:15.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.99 小脳:- 脳幹:2.78 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.29 網膜:- 目:- 動脈:2.52 静脈:- リンパ節:0.71 末梢血:- 脾臓:0.79 胸腺:2.49 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.77 皮膚:3.99
RNA-seq 大脳:5.03 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:218.10 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:7.40 心臓:37.20 骨格筋:71 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:246.70     肝臓:-        肺:10    膀胱:463.30 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:22.90 唾液腺:54
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.56 胎盤:0.62 前立腺:3.73 卵巣:2.95 精巣:2.12 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.42 腸:2.87 結腸:2.98     肝臓:0.64    肺:2.95 膀胱:5.94 腎臓:- 下垂体:0.70 甲状腺:- 副腎:1.67 膵臓:0.84 乳腺:2.74 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:20.64 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.13        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_201639
Gene ID 233335
Unigene ID Mm.60526
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000030554

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_015286, NM_145728
ラット [0]  

染色体

7C  [74,875,047  -  74,904,628]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
15265691
15368895
15872089
16141072
16141073
16602821
16817202
17356066
17654553
18287559
19124017
19229966
21267068
21386911
22008794

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008150  biological_process

Cellular Component

GO:0005912  adherens junction
GO:0030054  cell junction
GO:0043034  costamere
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0005882  intermediate filament
GO:0016020  membrane
GO:0060053  neurofilament cytoskeleton
GO:0030018  Z disc

Molecular Function

GO:0019215  intermediate filament binding
GO:0005515  protein binding
GO:0030674  protein binding, bridging
GO:0005200  structural constituent of cytoskeleton
GO:0008307  structural constituent of muscle
GO:0005198  structural molecule activity
GO:0017166  vinculin binding