peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1

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同義遺伝子名

Ppwd1, A330090G21Rik, 4632422M10Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:3.50 小脳:36.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:57.30 脊柱:189.10 網膜:128.60 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:49.40 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:15.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.82 小脳:- 脳幹:2.46 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.51 網膜:- 目:- 動脈:3.13 静脈:- リンパ節:3.49 末梢血:- 脾臓:3.47 胸腺:3.32 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.41 皮膚:3.07
RNA-seq 大脳:0.93 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:23 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:9.10        肺:40.20    膀胱:- 腎臓:8.10 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:6.50 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.93 胎盤:2.70 前立腺:2.64 卵巣:3.05 精巣:3.41 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.66 腸:2.74 結腸:2.84     肝臓:2.93    肺:2.78 膀胱:2.99 腎臓:- 下垂体:3.24 甲状腺:- 副腎:2.61 膵臓:2.83 乳腺:2.89 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.12 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.65        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_172807
Gene ID 238831
Unigene ID Mm.98910
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000021713

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_015342
ラット[1]  NM_001106406

染色体

13D1  [104,995,201  -  105,018,924]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015891  Cyclophilin-like
IPR002130  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type
IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11076861
11125038
11217851
12466851
12477932
12520002
16141072
16141073
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008150  biological_process
GO:0006397  mRNA processing
GO:0006457  protein folding
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0016853  isomerase activity
GO:0003674  molecular_function
GO:0003755  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity