transcription elongation factor A (SII) N-terminal and central domain containing

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

A630018P17Rik, MGC93029, RIKEN cDNA A630018P17 gene, Gm390

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:17.40 小脳:18.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:57.30 脊柱:47.30 網膜:32.10 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:13.20 胸腺:39.50 骨髄:- 脂肪:638.20 骨:12.50 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.55 小脳:- 脳幹:1.51 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:1.51 網膜:- 目:- 動脈:2.07 静脈:- リンパ節:2.20 末梢血:- 脾臓:2.04 胸腺:2.03 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.19 皮膚:1.91
RNA-seq 大脳:0.41 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:27.60 前立腺:- 卵巣:11.50 精巣:7.40 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:9.10        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:12.90 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:37.50 乳腺:6.50 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.98 胎盤:3.05 前立腺:1.46 卵巣:2.34 精巣:1.34 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.07 腸:1.92 結腸:1.77     肝臓:1.30    肺:2.10 膀胱:1.92 腎臓:- 下垂体:2.10 甲状腺:- 副腎:1.64 膵臓:2.03 乳腺:1.53 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.23 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:0.99        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001007577
Gene ID 245695
Unigene ID Mm.336318
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000051224

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_152634
ラット[1]  NM_001109015

染色体

XF5  [162,937,744  -  162,956,499]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003618  Transcription elongation factor S-II, central domain
IPR017890  Transcription elongation factor S-IIM
IPR016492  Transcription elongation factor, IIS

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
15489334
16141072
16141073
18799693
22967998

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0032784  regulation of RNA elongation
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0003674  molecular_function