procollagen lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2

同義遺伝子名

Lysyl hydroxylase 2, Plod2, lysyl hydroxylase 2, Plod-2, LH2, procollagen lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, D530025C14Rik

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:33

小脳:18.40

脳幹:158.90

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:458.60

脊柱:-

網膜:96.40

目:15.20

動脈:84.40

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:158

胸腺:29.60

骨髄:64.10

脂肪:212.70

骨:87.70

皮膚:126.70

GeneChip

大脳:5.27

小脳:5.52

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:5.63

脊柱:5.71

網膜:5.45

目:6.17

動脈:-

静脈:10.30

リンパ節:5.67

末梢血:-

脾臓:5.99

胸腺:-

骨髄:5.23

脂肪:5.76

骨:8.24

皮膚:5.30

CAGE

大脳:2.01

小脳:-

脳幹:2.21

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:2.36

網膜:-

目:-

動脈:3.26

静脈:-

リンパ節:2.01

末梢血:-

脾臓:2.14

胸腺:1.50

骨髄:-

脂肪:-

骨:2.29

皮膚:2.01

RNA-seq

大脳:1.15

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:130.90

胎盤:82.80

前立腺:92.60

卵巣:46

精巣:81.30

心臓:18.60

骨格筋:35.50

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:140.60

膀胱:198.50

腎臓:24.20

下垂体:142.10

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:46.90

乳腺:101.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.62

胎盤:8.81

前立腺:7.54

卵巣:10.05

精巣:6.14

心臓:7.39

骨格筋:5.54

食道:-

胃:6.72

腸:6.02

結腸:-

肝臓:4.78

肺:8

膀胱:7.65

腎臓:7.99

下垂体:8.32

甲状腺:-

副腎:10.91

膵臓:5.61

乳腺:7.04

唾液腺:6.77

CAGE

子宮:4.75

胎盤:4.93

前立腺:2.49

卵巣:5.34

精巣:1.48

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:2.44

腸:2.13

結腸:1.52

肝臓:1.12

肺:3.93

膀胱:3.68

腎臓:-

下垂体:4.06

甲状腺:-

副腎:5.09

膵臓:1.30

乳腺:1.96

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:1.65

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:0

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001142916
Gene ID	26432
Unigene ID	Mm.79983
Probe set ID	1416686_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000032374

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]	NM_000935, NM_182943
ラット[2]	NM_001142915, NM_175869

染色体

9E3.3 [92,437,061 - 92,503,266]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005123	Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase
IPR006620	Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit

GO:0005783	endoplasmic reticulum
GO:0016020	membrane

GO:0005506	iron ion binding
GO:0031418	L-ascorbic acid binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0016491	oxidoreductase activity
GO:0016705	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
GO:0016706	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0008475	procollagen-lysine 5-dioxygenase activity

procollagen lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function