SNF2 histone linker PHD RING helicase

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同義遺伝子名

AA450458, BC006883, SNF2 histone linker PHD RING helicase, Shprh, AU024614, E130018M05, D230017O13Rik, 2610103K11Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:79.90 小脳:110.50 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:19.10 脊柱:- 網膜:96.40 目:106.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.80 末梢血:14.40 脾臓:26.30 胸腺:118.60 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:71.30
GeneChip 大脳:7.37 小脳:8.17 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.71 脊柱:6.75 網膜:7.30 目:7.21 動脈:- 静脈:7.22 リンパ節:7.95 末梢血:- 脾臓:7.82 胸腺:- 骨髄:7.46 脂肪:6.95 骨:7.44 皮膚:7.40
CAGE 大脳:3.58 小脳:- 脳幹:3.29 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.45 網膜:- 目:- 動脈:3.39 静脈:- リンパ節:3.89 末梢血:- 脾臓:2.79 胸腺:3.27 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.25 皮膚:3.09
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:23 精巣:29.60 心臓:18.60 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:35.20     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:32.20 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:75.10 乳腺:49 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.03 胎盤:6.79 前立腺:6.87 卵巣:7.34 精巣:6.39 心臓:6.53 骨格筋:6.60 食道:- 胃:6.60 腸:6.61 結腸:- 肝臓:6.64 肺:7.07 膀胱:7.34 腎臓:6.24 下垂体:7.04 甲状腺:- 副腎:6.74 膵臓:5.89 乳腺:6.89 唾液腺:6
CAGE 子宮:2.94 胎盤:2.32 前立腺:2.81 卵巣:3.35 精巣:2.55 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.75 腸:2.06 結腸:2.37     肝臓:2.64    肺:3.21 膀胱:3.06 腎臓:- 下垂体:3.13 甲状腺:- 副腎:3.11 膵臓:3.32 乳腺:2.82 唾液腺:-
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001077707
Gene ID 268281
Unigene ID Mm.133101
Probe set ID 1452261_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000090112

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001042683, NM_173082
ラット [0]  

染色体

10A1  [10,869,225  -  10,937,393]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR005818  Histone H1/H5
IPR011991  Winged helix repressor DNA-binding
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12837266
14610273
15618518
15747579
16141072
16141073
16919269
21267068
21396873

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008150  biological_process
GO:0006281  DNA repair
GO:0006334  nucleosome assembly
GO:0006974  response to DNA damage stimulus

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0000786  nucleosome
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016874  ligase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0008270  zinc ion binding