senataxin

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同義遺伝子名

mKIAA0625, senataxin, SCAR1, A130090N03, Setx, AOA2, Als4, A930037J23Rik, AW060766, Sen1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:66 小脳:110.50 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:19.10 脊柱:47.30 網膜:192.90 目:83.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:75.60 末梢血:57.50 脾臓:131.70 胸腺:88.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:37.60 皮膚:15.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.27 小脳:- 脳幹:3.22 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.20 網膜:- 目:- 動脈:3.04 静脈:- リンパ節:4.09 末梢血:- 脾臓:3.29 胸腺:3.56 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.06 皮膚:2.94
RNA-seq 大脳:1.27 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:96.70 前立腺:- 卵巣:46 精巣:199.50 心臓:55.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:-        肺:80.30    膀胱:- 腎臓:16.10 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:75.10 乳腺:71.80 唾液腺:108
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.20 胎盤:2.52 前立腺:2.69 卵巣:3.25 精巣:6.38 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.35 腸:2.78 結腸:2.87     肝臓:2.70    肺:3.13 膀胱:2.89 腎臓:- 下垂体:3.49 甲状腺:- 副腎:2.89 膵臓:2.56 乳腺:2.96 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.45 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.00        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_198033
Gene ID 269254
Unigene ID Mm.41867
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000043535

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_015046
ラット[2]  NM_015046

染色体

2A3  [28,979,701  -  29,037,991]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
11544199
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
14621295
14770181
16141072
16141073
17967808
18799693
20064376
21677750
22767893
23180766
23593030

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007623  circadian rhythm
GO:0006281  DNA repair
GO:0006302  double-strand break repair
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0006369  termination of RNA polymerase II transcription

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding