synaptotagmin-like 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

PSGL-1, Slp1, Sytl1, Exophilin-7, Synaptotagmin-like protein 1, 9030417L18, MGC7008, synaptotagmin-like 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:5.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:76.40 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:54 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:25 皮膚:95
GeneChip 大脳:5.61 小脳:5.53 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.67 脊柱:5.72 網膜:5.64 目:6.80 動脈:- 静脈:7.18 リンパ節:6.06 末梢血:- 脾臓:5.68 胸腺:- 骨髄:6.40 脂肪:6.41 骨:5.81 皮膚:8.57
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:1.02 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:158.60     肝臓:9.10        肺:70.30    膀胱:66.20 腎臓:16.10 下垂体:- 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:18.80 乳腺:78.40 唾液腺:216
GeneChip 子宮:6.71 胎盤:6.02 前立腺:8.75 卵巣:6.04 精巣:6.04 心臓:5.70 骨格筋:5.55 食道:- 胃:8.37 腸:7.46 結腸:- 肝臓:6.22 肺:5.67 膀胱:8.31 腎臓:5.82 下垂体:6.78 甲状腺:- 副腎:5.21 膵臓:8.56 乳腺:6.81 唾液腺:8.98
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.21 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.08        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_031393
Gene ID 269589
Unigene ID Mm.25660
Probe set ID 1450240_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000028860

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_001193308, NM_032872
ラット[1]  NM_001025651, NM_032872

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000008  C2 calcium-dependent membrane targeting
IPR008973  C2 calcium/lipid-binding domain, CaLB
IPR018029  C2 membrane targeting protein
IPR010911  Rab-binding domain
IPR011011  Zinc finger, FYVE/PHD-type
IPR013083  Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11076861
11125038
11217851
11243866
11773082
11980908
12466851
12477932
12590134
15449545
15489334
16141072
16141073
16602821
18266782
18477466
18799693
19906978
21677750
22438581
23223571

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006887  exocytosis
GO:0006886  intracellular protein transport
GO:0016192  vesicle-mediated transport

Cellular Component

GO:0019897  extrinsic to plasma membrane
GO:0042470  melanosome
GO:0016020  membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0042043  neurexin binding
GO:0005515  protein binding
GO:0017137  Rab GTPase binding