nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 1

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同義遺伝子名

Nufip, Nuclear FMRP-interacting protein 1, Nufip1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:15.60 小脳:- 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:32.10 目:7.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.80 末梢血:28.80 脾臓:144.80 胸腺:39.50 骨髄:25.60 脂肪:- 骨:37.60 皮膚:23.80
GeneChip 大脳:6.09 小脳:5.90 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.85 脊柱:5.98 網膜:6.17 目:6.03 動脈:- 静脈:6.26 リンパ節:7.04 末梢血:- 脾臓:6.85 胸腺:- 骨髄:6.42 脂肪:6.13 骨:6.36 皮膚:6.25
CAGE 大脳:3.13 小脳:- 脳幹:2.85 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.90 網膜:- 目:- 動脈:2.69 静脈:- リンパ節:3.22 末梢血:- 脾臓:2.81 胸腺:3.32 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.59 皮膚:2.83
RNA-seq 大脳:2.21 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:27.60 前立腺:- 卵巣:34.50 精巣:36.90 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:-     肝臓:27.20        肺:40.20    膀胱:- 腎臓:32.20 下垂体:64.60 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:46.90 乳腺:22.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.63 胎盤:6.84 前立腺:6.06 卵巣:6.58 精巣:7.01 心臓:6.25 骨格筋:6.37 食道:- 胃:6.25 腸:6.46 結腸:- 肝臓:6.22 肺:6.26 膀胱:6.04 腎臓:6.30 下垂体:6.59 甲状腺:- 副腎:6.40 膵臓:5.90 乳腺:6.39 唾液腺:6.60
CAGE 子宮:3.23 胎盤:3.18 前立腺:2.54 卵巣:2.92 精巣:3.83 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.85 腸:3.01 結腸:3.09     肝臓:2.88    肺:2.84 膀胱:2.85 腎臓:- 下垂体:3.18 甲状腺:- 副腎:2.93 膵臓:2.66 乳腺:2.76 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.64 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.64        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_013745
Gene ID 27275
Unigene ID Mm.21138
Probe set ID 1448802_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000022009

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]  NM_012345
ラット[1]  NM_001007758

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015880  Zinc finger, C2H2-like
IPR007087  Zinc finger, C2H2-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10556305
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
15489334
15618518
16141072
16141073
16325481
16602821
20412781

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000492  box C/D snoRNP assembly
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0022626  cytosolic ribosome
GO:0016363  nuclear matrix
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005726  perichromatin fibrils
GO:0070761  pre-snoRNP complex
GO:0048786  presynaptic active zone
GO:0008023  transcription elongation factor complex

Molecular Function

GO:0042802  identical protein binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0005515  protein binding
GO:0030674  protein binding, bridging
GO:0003723  RNA binding
GO:0030515  snoRNA binding