phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchange factor 1

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同義遺伝子名

Setd6, P-REX1, G630042G04, BC067047, SET domain containing 6

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:269.20 小脳:128.90 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:57.30 脊柱:236.40 網膜:64.30 目:60.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:108 末梢血:57.50 脾臓:79 胸腺:168 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:87.70 皮膚:39.60
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.74 小脳:- 脳幹:3.79 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.84 網膜:- 目:- 動脈:2.05 静脈:- リンパ節:4.39 末梢血:- 脾臓:4.08 胸腺:4.49 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.49 皮膚:2.65
RNA-seq 大脳:13.03 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:469.40 前立腺:- 卵巣:23 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:52.90     肝臓:54.30        肺:60.30    膀胱:132.40 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:32.60 唾液腺:162
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.75 胎盤:3.85 前立腺:1.46 卵巣:2.28 精巣:0.99 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.07 腸:1.65 結腸:2.60     肝臓:2.23    肺:3.60 膀胱:2.17 腎臓:- 下垂体:2.95 甲状腺:- 副腎:2.87 膵臓:1.61 乳腺:2.87 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.02 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.70        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_177782
Gene ID 277360
Unigene ID Mm.34420
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000039621

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_020820
ラット[1]  NM_001135718

染色体

2H3  [166,391,842  -  166,539,332]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000591  DEP domain
IPR001849  Pleckstrin homology
IPR011991  Winged helix repressor DNA-binding

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
15368895
15858067
16141072
16141073
16243035
16243036
18334636
18502673
18973680
20694145
21178006
21179475
21257963
21267068
21677750
22002247
22109529
22207728
22965143
23343834
23431145
24327733

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030833  regulation of actin filament polymerization
GO:0050773  regulation of dendrite development
GO:0035023  regulation of Rho protein signal transduction

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0043198  dendritic shaft
GO:0030426  growth cone
GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0016020  membrane
GO:0048471  perinuclear region of cytoplasm
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005085  guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0005543  phospholipid binding
GO:0005089  Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity