PRP19/PSO4 pre-mRNA processing factor 19 homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

NMP200, Nuclear matrix protein 200, Prpf19, Pre-mRNA-splicing factor 19, AA617263, prp19 beta, Snev, PRP19/PSO4 homolog, D19Wsu55e, Prp19, Nuclear matrix protein SNEV, PSO4, AL024362

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:10.89 小脳:10.88 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:11.02 脊柱:11.50 網膜:10.36 目:10.20 動脈:- 静脈:10.27 リンパ節:10.20 末梢血:- 脾臓:10.33 胸腺:- 骨髄:9.69 脂肪:10.26 骨:9.88 皮膚:10.18
CAGE 大脳:4.98 小脳:- 脳幹:5.38 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:5.53 網膜:- 目:- 動脈:4.39 静脈:- リンパ節:4.58 末梢血:- 脾臓:4.68 胸腺:4.55 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.68 皮膚:4.78
RNA-seq 大脳:43.60 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:11.16 胎盤:9.99 前立腺:10.58 卵巣:11.03 精巣:9.47 心臓:11.40 骨格筋:11.29 食道:- 胃:9.92 腸:10.10 結腸:- 肝臓:10.57 肺:9.78 膀胱:10.05 腎臓:10.14 下垂体:10.69 甲状腺:- 副腎:10.73 膵臓:10.15 乳腺:10.67 唾液腺:10.99
CAGE 子宮:5.01 胎盤:4.47 前立腺:4.52 卵巣:4.91 精巣:4.33 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:4.05 腸:4.33 結腸:4.08     肝臓:5.07    肺:4.41 膀胱:4.54 腎臓:- 下垂体:4.78 甲状腺:- 副腎:4.81 膵臓:4.89 乳腺:4.49 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:34.82 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:23.27        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_134129
Gene ID 28000
Unigene ID -
Probe set ID 1419839_x_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000024735

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_014502
ラット[1]  NM_139333

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472  G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR003613  U box domain
IPR001680  WD40 repeat
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain
IPR013083  Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7671812
8889548
9811942
10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12904583
14610273
15489334
15782199
16141072
16141073
16352598
17118936
17283042
17349974
17964290
18287559
18447650
18480465
18799693
21677750
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006281  DNA repair
GO:0001833  inner cell mass cell proliferation
GO:0008610  lipid biosynthetic process
GO:0006397  mRNA processing
GO:0045665  negative regulation of neuron differentiation
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0048711  positive regulation of astrocyte differentiation
GO:0045666  positive regulation of neuron differentiation
GO:0048026  positive regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000209  protein polyubiquitination
GO:0016567  protein ubiquitination
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0008380  RNA splicing
GO:0000245  spliceosome assembly

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0005811  lipid particle
GO:0016607  nuclear speck
GO:0005634  nucleus
GO:0000974  Prp19 complex
GO:0005681  spliceosomal complex
GO:0000151  ubiquitin ligase complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0042802  identical protein binding
GO:0005515  protein binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0034450  ubiquitin-ubiquitin ligase activity