lysine (K)-specific demethylase 2B

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

Fbxl10, F-box protein FBL10, mKIAA3014, E430001G17, Kiaa3014, PCCX2, KIAA3014, Fbl10, Jhdm1b, Cxxc2, F-box/LRR-repeat protein 10, F-box and leucine-rich repeat protein 10

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:109.40 小脳:36.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:19.10 脊柱:94.60 網膜:128.60 目:60.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.80 末梢血:57.50 脾臓:- 胸腺:39.50 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:25 皮膚:23.80
GeneChip 大脳:7.09 小脳:7.54 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.81 脊柱:6.58 網膜:7.49 目:7.74 動脈:- 静脈:7.63 リンパ節:8.76 末梢血:- 脾臓:8.69 胸腺:- 骨髄:8.66 脂肪:7.26 骨:8.31 皮膚:8.51
CAGE 大脳:2.30 小脳:- 脳幹:1.87 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:1.82 網膜:- 目:- 動脈:1.89 静脈:- リンパ節:2.23 末梢血:- 脾臓:2.80 胸腺:2.61 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.88 皮膚:2.63
RNA-seq 大脳:2.95 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:130.90 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:114.90 精巣:81.30 心臓:74.40 骨格筋:71 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:60.30    膀胱:- 腎臓:64.50 下垂体:180.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:56.30 乳腺:49 唾液腺:54
GeneChip 子宮:8.29 胎盤:7.92 前立腺:8.39 卵巣:7.75 精巣:8.93 心臓:7.27 骨格筋:7.55 食道:- 胃:7.74 腸:7.47 結腸:- 肝臓:6.80 肺:7.35 膀胱:7.92 腎臓:7.13 下垂体:7.16 甲状腺:- 副腎:6.88 膵臓:6.78 乳腺:7.64 唾液腺:8.14
CAGE 子宮:2.76 胎盤:1.96 前立腺:1.69 卵巣:2.55 精巣:4.41 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.91 腸:1.49 結腸:2.13     肝臓:2.13    肺:2.21 膀胱:2.45 腎臓:- 下垂体:1.86 甲状腺:- 副腎:1.92 膵臓:1.30 乳腺:2.54 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.73 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.22        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001005866
Gene ID 30841
Unigene ID Mm.86406
Probe set ID 1452198_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000029475

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001005366, NM_032590
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787  Zinc finger, PHD-finger
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10531037
10922068
11042159
11076861
11125038
11217851
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
14621295
15489334
15520277
15782199
16141072
16141073
16602821
17296600
17967808
18022353
18276649
18287559
18799693
18836456
18838535
19202064
21220025
21267068
21310926
21540074
21757686
22496869
22522173
22825849
23256043
23321669
23395003
23502314
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0048596  embryonic camera-type eye morphogenesis
GO:0030900  forebrain development
GO:0021592  fourth ventricle development
GO:0030902  hindbrain development
GO:0016577  histone demethylation
GO:0021993  initiation of neural tube closure
GO:0021670  lateral ventricle development
GO:0030901  midbrain development
GO:0021555  midbrain-hindbrain boundary morphogenesis
GO:0043524  negative regulation of neuron apoptosis
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0055114  oxidation reduction
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007283  spermatogenesis
GO:0021678  third ventricle development
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0031519  PcG protein complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0032452  histone demethylase activity
GO:0051864  histone demethylase activity (H3-K36 specific)
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0019843  rRNA binding
GO:0008270  zinc ion binding