ligase IV, DNA, ATP-dependent

同義遺伝子名

ligase IV, DNA, ATP-dependent, DNA ligase 4, ligase IV, Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4, 5830471N16Rik, Lig4, DNA ligase IV

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:33

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:38.20

脊柱:-

網膜:32.10

目:15.20

動脈:-

静脈:-

リンパ節:10.80

末梢血:-

脾臓:13.20

胸腺:49.40

骨髄:12.80

脂肪:-

骨:-

皮膚:7.90

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:2.02

小脳:-

脳幹:2.30

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:2.11

網膜:-

目:-

動脈:2.16

静脈:-

リンパ節:1.86

末梢血:-

脾臓:1.87

胸腺:3.95

骨髄:-

脂肪:-

骨:2.29

皮膚:1.84

RNA-seq

大脳:0.80

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:13.80

前立腺:-

卵巣:-

精巣:14.80

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:32.70

腸:-

結腸:17.60

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:19.60

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:1.90

胎盤:1.75

前立腺:2.06

卵巣:1.71

精巣:4.40

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:1.35

腸:2.10

結腸:1.89

肝臓:2.06

肺:2.25

膀胱:2.17

腎臓:-

下垂体:2.29

甲状腺:-

副腎:1.80

膵臓:2.03

乳腺:2.01

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:1.32

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:1.30

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_176953
Gene ID	319583
Unigene ID	Mm.80584
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSMUSG00000049717

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]	NM_001098268, NM_002312, NM_206937
ラット [0]

染色体

8A1.1 [9,970,020 - 9,977,686]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR012310

ATP dependent DNA ligase, central

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007049	cell cycle
GO:0051301	cell division
GO:0008283	cell proliferation
GO:0007417	central nervous system development
GO:0051276	chromosome organization
GO:0006266	DNA ligation
GO:0051102	DNA ligation during DNA recombination
GO:0051103	DNA ligation during DNA repair
GO:0006310	DNA recombination
GO:0006281	DNA repair
GO:0006260	DNA replication
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0006303	double-strand break repair via nonhomologous end joining
GO:0033152	immunoglobulin V(D)J recombination
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0045190	isotype switching
GO:0006273	lagging strand elongation
GO:0043524	negative regulation of neuron apoptosis
GO:0051402	neuron apoptosis
GO:0006289	nucleotide-excision repair
GO:0006297	nucleotide-excision repair, DNA gap filling
GO:0048146	positive regulation of fibroblast proliferation
GO:0050769	positive regulation of neurogenesis
GO:0002328	pro-B cell differentiation
GO:0006974	response to DNA damage stimulus
GO:0010332	response to gamma radiation
GO:0010212	response to ionizing radiation
GO:0010165	response to X-ray
GO:0000012	single strand break repair
GO:0035019	somatic stem cell maintenance
GO:0033077	T cell differentiation in the thymus
GO:0033153	T cell receptor V(D)J recombination
GO:0033151	V(D)J recombination

Cellular Component

GO:0005694	chromosome
GO:0000793	condensed chromosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0032807	DNA ligase IV complex
GO:0005958	DNA-dependent protein kinase-DNA ligase 4 complex
GO:0005925	focal adhesion
GO:0070419	nonhomologous end joining complex
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003910	DNA ligase (ATP) activity
GO:0003909	DNA ligase activity
GO:0016874	ligase activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding

ligase IV, DNA, ATP-dependent

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function