oculocerebrorenal syndrome of Lowe

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同義遺伝子名

9530014D17Rik, oculocerebrorenal syndrome of Lowe, BB143339, OCRL1, Ocrl

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:86.80 小脳:36.80 脳幹:127.10 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:57.30 脊柱:94.60 網膜:160.70 目:53.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:32.40 末梢血:28.80 脾臓:13.20 胸腺:69.20 骨髄:- 脂肪:425.40 骨:12.50 皮膚:23.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.70 小脳:- 脳幹:3.65 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.41 網膜:- 目:- 動脈:3.30 静脈:- リンパ節:2.77 末梢血:- 脾臓:2.31 胸腺:2.22 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.19 皮膚:2.96
RNA-seq 大脳:2.54 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:13.80 前立腺:30.90 卵巣:23 精巣:44.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:45.30        肺:90.40    膀胱:198.50 腎臓:24.20 下垂体:180.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:84.40 乳腺:13.10 唾液腺:54
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.13 胎盤:2.42 前立腺:2.88 卵巣:3.34 精巣:1.18 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.04 腸:1.99 結腸:2.16     肝臓:1.64    肺:2.95 膀胱:3.35 腎臓:- 下垂体:3.66 甲状腺:- 副腎:3.81 膵臓:2.33 乳腺:2.77 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.61 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.81        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_177215
Gene ID 320634
Unigene ID Mm.210343
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000001173

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_000276, NM_001587
ラット [0]  

染色体

XA4  [45,265,564  -  45,319,045]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005135  Endonuclease/exonuclease/phosphatase
IPR000300  Inositol polyphosphate related phosphatase
IPR008936  Rho GTPase activation protein
IPR000198  RhoGAP

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9048911
9593760
10349636
11042159
11076861
11217851
11784089
12466851
12477932
14610273
14681479
15782199
16141072
16141073
18425126
19021631
19666558
20195868
20622009
21183592
21267068
23153494

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030030  cell projection organization
GO:0042384  cilium assembly
GO:0001701  in utero embryonic development
GO:0046856  phosphoinositide dephosphorylation
GO:0032855  positive regulation of Rac GTPase activity
GO:0032314  regulation of Rac GTPase activity
GO:0007165  signal transduction

Cellular Component

GO:0042995  cell projection
GO:0005929  cilium
GO:0030136  clathrin-coated vesicle
GO:0005905  coated pit
GO:0005737  cytoplasm
GO:0031410  cytoplasmic vesicle
GO:0005769  early endosome
GO:0005768  endosome
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0005622  intracellular
GO:0016020  membrane
GO:0005634  nucleus
GO:0001750  photoreceptor outer segment
GO:0005886  plasma membrane
GO:0005802  trans-Golgi network

Molecular Function

GO:0016787  hydrolase activity
GO:0004439  phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity
GO:0030675  Rac GTPase activator activity
GO:0048365  Rac GTPase binding