jumonji C domain-containing histone demethylase 1 homolog D (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

Protein KIAA1718, RIKEN cDNA A630082K20 gene, A630082K20Rik, mKIAA1718, BB041802, Kiaa1718

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:5.96 小脳:6.97 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.28 脊柱:5.26 網膜:4.99 目:4.93 動脈:- 静脈:6.37 リンパ節:7.53 末梢血:- 脾臓:7.41 胸腺:- 骨髄:8.86 脂肪:6.52 骨:8.07 皮膚:6.19
CAGE 大脳:2.69 小脳:- 脳幹:2.26 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.36 網膜:- 目:- 動脈:2.72 静脈:- リンパ節:3.27 末梢血:- 脾臓:3.41 胸腺:2.49 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.18 皮膚:3.06
RNA-seq 大脳:2.72 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.03 胎盤:5.27 前立腺:4.76 卵巣:5.86 精巣:5.26 心臓:5.72 骨格筋:6.67 食道:- 胃:6.48 腸:7.23 結腸:- 肝臓:5.63 肺:5.51 膀胱:5.93 腎臓:5.79 下垂体:4.67 甲状腺:- 副腎:5.26 膵臓:4.57 乳腺:5.84 唾液腺:5.32
CAGE 子宮:2.99 胎盤:1.72 前立腺:2.37 卵巣:2.73 精巣:2.75 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.35 腸:2.52 結腸:2.94     肝臓:1.94    肺:2.96 膀胱:2.27 腎臓:- 下垂体:1.86 甲状腺:- 副腎:2.50 膵臓:2.45 乳腺:1.86 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.47 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.70        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001033430
Gene ID 338523
Unigene ID -
Probe set ID 1427359_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000042599

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_030647
ラット[1]  NM_030647

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787  Zinc finger, PHD-finger
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
14621295
15489334
15618518
15741177
16141072
16141073
20194436
20629981
20981832
21677750
22143793

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0070544  histone H3-K36 demethylation
GO:0033169  histone H3-K9 demethylation
GO:0007399  nervous system development
GO:0055114  oxidation reduction
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0051864  histone demethylase activity (H3-K36 specific)
GO:0032454  histone demethylase activity (H3-K9 specific)
GO:0005506  iron ion binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0035064  methylated histone residue binding
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0008270  zinc ion binding