collagen, type XXVII, alpha 1

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同義遺伝子名

mKIAA1870, 5730512J02Rik, Col27a1, AI449266, procollagen, type XXVII, alpha 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:10.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:76.40 脊柱:- 網膜:- 目:7.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:43.20 末梢血:- 脾臓:39.50 胸腺:29.60 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.50 皮膚:31.70
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.61 小脳:- 脳幹:1.41 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:1.66 網膜:- 目:- 動脈:3.08 静脈:- リンパ節:0.83 末梢血:- 脾臓:0.62 胸腺:1.17 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.84 皮膚:0.84
RNA-seq 大脳:1.24 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:36.90 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:17.60     肝臓:27.20        肺:10    膀胱:- 腎臓:16.10 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:28.10 乳腺:6.50 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.30 胎盤:1.17 前立腺:1.46 卵巣:2.32 精巣:0.75 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.91 腸:1.05 結腸:1.19     肝臓:3.05    肺:2.08 膀胱:1.89 腎臓:- 下垂体:1.75 甲状腺:- 副腎:0.97 膵臓:2.03 乳腺:1.59 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:0.82 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.54        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_025685
Gene ID 373864
Unigene ID Mm.194116
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000045672

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_032888
ラット[1]  NM_198747

染色体

4B3  [62,875,038  -  62,996,025]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12714037
12766169
15368895
16141072
16141073
17331945
19414009
19884258
21267068
21677750
22206015

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008150  biological_process

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0005576  extracellular region
GO:0005583  fibrillar collagen
GO:0005578  proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005201  extracellular matrix structural constituent
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003674  molecular_function