cleavage and polyadenylation specific factor 6

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同義遺伝子名

AI256641, HPBRII-7, Cleavage and polyadenylation specificity factor 6, cleavage and polyadenylation specific factor 6, 4733401N12Rik, CFIM, Cpsf6, HPBRII-4, CFIM68

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:72.90 小脳:128.90 脳幹:95.30 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:38.20 脊柱:189.10 網膜:128.60 目:83.60 動脈:337.60 静脈:- リンパ節:75.60 末梢血:100.60 脾臓:158 胸腺:138.30 骨髄:64.10 脂肪:- 骨:12.50 皮膚:126.70
GeneChip nodata
CAGE 大脳:4.58 小脳:- 脳幹:4.45 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.40 網膜:- 目:- 動脈:4.07 静脈:- リンパ節:5.07 末梢血:- 脾臓:4.27 胸腺:4.63 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.11 皮膚:4.30
RNA-seq 大脳:4.07 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:124.30 前立腺:30.90 卵巣:57.50 精巣:88.70 心臓:93 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:110.90 結腸:70.50     肝臓:54.30        肺:120.50    膀胱:- 腎臓:40.30 下垂体:90.40 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:18.80 乳腺:91.40 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:4.23 胎盤:3.91 前立腺:3.95 卵巣:4.42 精巣:4.29 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.62 腸:3.81 結腸:3.80     肝臓:3.78    肺:4.19 膀胱:3.95 腎臓:- 下垂体:4.34 甲状腺:- 副腎:4.08 膵臓:3.80 乳腺:3.98 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.20 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.17        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001013391
Gene ID 432508
Unigene ID Mm.288682
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000055531

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_007007
ラット[1]  NM_001106785

染色体

10D2  [116,781,724  -  116,814,029]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
11544199
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
14729942
15226823
15489334
15782199
16107646
16141072
16141073
17967808
18032416
18799693
18809582
21267068
21677750
22083510
23180766
23665500
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006378  mRNA polyadenylation
GO:0006397  mRNA processing
GO:0051262  protein tetramerization

Cellular Component

GO:0005849  mRNA cleavage factor complex
GO:0005634  nucleus
GO:0042382  paraspeckles
GO:0030529  ribonucleoprotein complex

Molecular Function

GO:0003729  mRNA binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0003723  RNA binding