Parkinson disease (autosomal recessive, juvenile) 2, parkin

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同義遺伝子名

PRKN, Parkin, MGC130518, Park2, Prkn, parkin, Ubiquitin E3 ligase PRKN

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:114.70

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:25

皮膚:-

GeneChip

大脳:4.39

小脳:4.41

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:4.71

脊柱:4.50

網膜:4.23

目:4.44

動脈:-

静脈:4.14

リンパ節:4.18

末梢血:-

脾臓:4.27

胸腺:-

骨髄:4.11

脂肪:4.53

骨:4.19

皮膚:4.26

CAGE

大脳:2.43

小脳:-

脳幹:2.22

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:2.29

網膜:-

目:-

動脈:2.33

静脈:-

リンパ節:1.64

末梢血:-

脾臓:1.06

胸腺:1.17

骨髄:-

脂肪:-

骨:1.02

皮膚:2.26

RNA-seq

大脳:1.31

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:23

精巣:14.80

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:38.80

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.19

胎盤:4.22

前立腺:4.48

卵巣:4.01

精巣:5.51

心臓:4.81

骨格筋:4.64

食道:-

胃:4.43

腸:4.27

結腸:-

肝臓:4.39

肺:4.24

膀胱:4.35

腎臓:4.78

下垂体:4.51

甲状腺:-

副腎:4.05

膵臓:4.68

乳腺:4.33

唾液腺:4.64

CAGE

子宮:1.69

胎盤:1.15

前立腺:2.43

卵巣:1.92

精巣:3.18

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:1.35

腸:0.58

結腸:1.19

肝臓:2.09

肺:2.10

膀胱:2.23

腎臓:-

下垂体:3.03

甲状腺:-

副腎:2.42

膵臓:2.19

乳腺:1.91

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:1.62

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:1.68

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_016694
Gene ID	50873
Unigene ID	Mm.311110
Probe set ID	1426135_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000023826

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]	NM_004562, NM_013987, NM_013988
ラット[1]	NM_020093, NM_013987, NM_013988

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000626	Ubiquitin
IPR019956	Ubiquitin subgroup
IPR019955	Ubiquitin supergroup

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008344	adult locomotory behavior
GO:0070842	aggresome assembly
GO:0006914	autophagy
GO:0008219	cell death
GO:0042417	dopamine metabolic process
GO:0051583	dopamine uptake
GO:0007612	learning
GO:0007626	locomotory behavior
GO:0000422	mitochondrion degradation
GO:0032232	negative regulation of actin filament bundle formation
GO:0060548	negative regulation of cell death
GO:0043524	negative regulation of neuron apoptosis
GO:0001933	negative regulation of protein amino acid phosphorylation
GO:0090201	negative regulation of release of cytochrome c from mitochondria
GO:0070997	neuron death
GO:0042415	norepinephrine metabolic process
GO:0043123	positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade
GO:0051865	protein autoubiquitination
GO:0070936	protein K48-linked ubiquitination
GO:0070534	protein K63-linked ubiquitination
GO:0019538	protein metabolic process
GO:0006513	protein monoubiquitination
GO:0000209	protein polyubiquitination
GO:0016567	protein ubiquitination
GO:0042787	protein ubiquitination during ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0010506	regulation of autophagy
GO:0046928	regulation of neurotransmitter secretion
GO:0050804	regulation of synaptic transmission
GO:0006986	response to unfolded protein
GO:0001964	startle response
GO:0001963	synaptic transmission, dopaminergic
GO:0035249	synaptic transmission, glutamatergic
GO:0006511	ubiquitin-dependent protein catabolic process

Cellular Component

GO:0016235	aggresome
GO:0030054	cell junction
GO:0042995	cell projection
GO:0005737	cytoplasm
GO:0031410	cytoplasmic vesicle
GO:0005829	cytosol
GO:0005783	endoplasmic reticulum
GO:0005794	Golgi apparatus
GO:0000139	Golgi membrane
GO:0005622	intracellular
GO:0016020	membrane
GO:0045121	membrane raft
GO:0005739	mitochondrion
GO:0043005	neuron projection
GO:0005634	nucleus
GO:0048471	perinuclear region of cytoplasm
GO:0005886	plasma membrane
GO:0014069	postsynaptic density
GO:0045211	postsynaptic membrane
GO:0043234	protein complex
GO:0045202	synapse
GO:0008021	synaptic vesicle

Molecular Function

GO:0016881	acid-amino acid ligase activity
GO:0051087	chaperone binding
GO:0019900	kinase binding
GO:0016874	ligase activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0030165	PDZ domain binding
GO:0005515	protein binding
GO:0032403	protein complex binding
GO:0019901	protein kinase binding
GO:0031625	ubiquitin protein ligase binding
GO:0004842	ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270	zinc ion binding

Parkinson disease (autosomal recessive, juvenile) 2, parkin

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function