SAM domain and HD domain, 1

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同義遺伝子名

Interferon-gamma-inducible protein Mg11, Mg11, SAM domain and HD domain-containing protein 1, Samhd1, E330031J07Rik, SAM domain and HD domain, 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:36.50 小脳:- 脳幹:63.60 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:32.10 目:83.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:97.20 末梢血:330.70 脾臓:632 胸腺:138.30 骨髄:602.60 脂肪:638.20 骨:100.20 皮膚:31.70
GeneChip 大脳:6.17 小脳:6.65 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.21 脊柱:6.26 網膜:7.10 目:7.73 動脈:- 静脈:8.04 リンパ節:11.57 末梢血:- 脾臓:11.32 胸腺:- 骨髄:10.43 脂肪:8.04 骨:10.22 皮膚:8
CAGE 大脳:2.15 小脳:- 脳幹:2.43 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.73 網膜:- 目:- 動脈:4.69 静脈:- リンパ節:6.77 末梢血:- 脾臓:5.45 胸腺:4.39 骨髄:- 脂肪:- 骨:5.96 皮膚:3.91
RNA-seq 大脳:2.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:82.80 前立腺:- 卵巣:91.90 精巣:14.80 心臓:74.40 骨格筋:71 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:70.50     肝臓:45.30        肺:160.70    膀胱:198.50 腎臓:32.20 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:176.30 唾液腺:54
GeneChip 子宮:8.43 胎盤:8.49 前立腺:7.99 卵巣:8.37 精巣:7.11 心臓:7.55 骨格筋:8.12 食道:- 胃:7.73 腸:8.65 結腸:- 肝臓:7.51 肺:9.94 膀胱:8.02 腎臓:7.15 下垂体:6.90 甲状腺:- 副腎:7.89 膵臓:7.38 乳腺:9.05 唾液腺:8.34
CAGE 子宮:4.00 胎盤:5.37 前立腺:3.76 卵巣:3.91 精巣:2.92 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:4.31 腸:4.56 結腸:4.85     肝臓:3.69    肺:5.76 膀胱:4.25 腎臓:- 下垂体:3.29 甲状腺:- 副腎:4.02 膵臓:3.68 乳腺:4.27 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:3.68 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.01        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001139520
Gene ID 56045
Unigene ID Mm.248478
Probe set ID 1418131_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000027639

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_015474
ラット[1]  NM_015474

染色体

2H1  [156,923,265  -  156,961,001]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003607  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain
IPR001660  Sterile alpha motif
IPR010993  Sterile alpha motif homology
IPR013761  Sterile alpha motif-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7884320
10349636
10922068
11042159
11064105
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
15489334
15769905
16141072
16141073
16602821
17015433
21267068
21677750
22069334
23076149
23872947
23972988
24035396

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051607  defense response to virus
GO:0045087  innate immune response
GO:0045088  regulation of innate immune response

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003824  catalytic activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0008081  phosphoric diester hydrolase activity
GO:0003723  RNA binding