pseudouridine synthase 1

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同義遺伝子名

A730013B20Rik, tRNA pseudouridylate synthase I, mPus1p, tRNA-uridine isomerase I, tRNA pseudouridine synthase A, pseudouridine synthase 1, MPUS1, Pus1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.08 小脳:7.29 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.62 脊柱:7.74 網膜:6.60 目:6.89 動脈:- 静脈:7.57 リンパ節:8.11 末梢血:- 脾臓:8.25 胸腺:- 骨髄:8 脂肪:7.69 骨:7.66 皮膚:7.56
CAGE 大脳:2.07 小脳:- 脳幹:2.44 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.29 網膜:- 目:- 動脈:2.34 静脈:- リンパ節:2.47 末梢血:- 脾臓:2.76 胸腺:2.25 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.53 皮膚:2.79
RNA-seq 大脳:5.06 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:8.08 胎盤:7.79 前立腺:8.04 卵巣:8.13 精巣:6.85 心臓:7.68 骨格筋:7.60 食道:- 胃:7.74 腸:8.18 結腸:- 肝臓:8.02 肺:6.96 膀胱:7.61 腎臓:8.40 下垂体:7.28 甲状腺:- 副腎:7.99 膵臓:8.63 乳腺:8.02 唾液腺:8.48
CAGE 子宮:2.94 胎盤:2.78 前立腺:2.49 卵巣:2.51 精巣:1.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.73 腸:3.21 結腸:3.28     肝臓:2.80    肺:2.10 膀胱:2.68 腎臓:- 下垂体:2.32 甲状腺:- 副腎:2.59 膵臓:3.45 乳腺:2.94 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:4.85        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001025562
Gene ID 56361
Unigene ID -
Probe set ID 1418869_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000029507

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]  NM_001002019, NM_001002020, NM_025215
ラット[1]  NM_001025563, NM_001002020, NM_025215

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001406  Pseudouridine synthase I, TruA
IPR020103  Pseudouridine synthase, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10094309
10349636
10512203
11027153
11042159
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11085940
11217851
12466851
12477932
12904583
14610273
15327771
15489334
15840001
16141072
16141073
17170069
18799693
21267068
21677750

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008152  metabolic process
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0001522  pseudouridine synthesis
GO:0009451  RNA modification
GO:0008033  tRNA processing
GO:0031119  tRNA pseudouridine synthesis

Cellular Component

GO:0005739  mitochondrion
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0016853  isomerase activity
GO:0030374  ligand-dependent nuclear receptor transcription coactivator activity
GO:0005515  protein binding
GO:0009982  pseudouridine synthase activity
GO:0003723  RNA binding