pseudouridine synthase 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

A730013B20Rik, tRNA pseudouridylate synthase I, mPus1p, tRNA-uridine isomerase I, tRNA pseudouridine synthase A, pseudouridine synthase 1, MPUS1, Pus1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.08 小脳:7.29 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.62 脊柱:7.74 網膜:6.60 目:6.89 動脈:- 静脈:7.57 リンパ節:8.11 末梢血:- 脾臓:8.25 胸腺:- 骨髄:8 脂肪:7.69 骨:7.66 皮膚:7.56
CAGE 大脳:2.07 小脳:- 脳幹:2.44 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.29 網膜:- 目:- 動脈:2.34 静脈:- リンパ節:2.47 末梢血:- 脾臓:2.76 胸腺:2.25 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.53 皮膚:2.79
RNA-seq 大脳:5.06 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:8.08 胎盤:7.79 前立腺:8.04 卵巣:8.13 精巣:6.85 心臓:7.68 骨格筋:7.60 食道:- 胃:7.74 腸:8.18 結腸:- 肝臓:8.02 肺:6.96 膀胱:7.61 腎臓:8.40 下垂体:7.28 甲状腺:- 副腎:7.99 膵臓:8.63 乳腺:8.02 唾液腺:8.48
CAGE 子宮:2.94 胎盤:2.78 前立腺:2.49 卵巣:2.51 精巣:1.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.73 腸:3.21 結腸:3.28     肝臓:2.80    肺:2.10 膀胱:2.68 腎臓:- 下垂体:2.32 甲状腺:- 副腎:2.59 膵臓:3.45 乳腺:2.94 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:4.85        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_019700
Gene ID 56361
Unigene ID -
Probe set ID 1418869_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000029507

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]  NM_001002019, NM_001002020, NM_025215
ラット[1]  NM_001025563, NM_001002020, NM_025215

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001406  Pseudouridine synthase I, TruA
IPR020103  Pseudouridine synthase, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10094309
10349636
10512203
11027153
11042159
11076861
11085940
11217851
12466851
12477932
12904583
14610273
15327771
15489334
15840001
16141072
16141073
17170069
18799693
21267068
21677750

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008152  metabolic process
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0001522  pseudouridine synthesis
GO:0009451  RNA modification
GO:0008033  tRNA processing
GO:0031119  tRNA pseudouridine synthesis

Cellular Component

GO:0005739  mitochondrion
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0016853  isomerase activity
GO:0030374  ligand-dependent nuclear receptor transcription coactivator activity
GO:0005515  protein binding
GO:0009982  pseudouridine synthase activity
GO:0003723  RNA binding