tRNA splicing endonuclease 34 homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

Leukocyte receptor cluster member 5 homolog, 0610027F08Rik, Leng5, tRNA-intron endonuclease Sen34, Sen34, Tsen34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:64.30 小脳:18.40 脳幹:127.10 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:152.90 脊柱:141.90 網膜:64.30 目:7.60 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:13.20 胸腺:19.80 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:37.60 皮膚:87.10
GeneChip 大脳:9.59 小脳:9.56 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.76 脊柱:9.59 網膜:8.75 目:8.81 動脈:- 静脈:9.98 リンパ節:8.85 末梢血:- 脾臓:8.69 胸腺:- 骨髄:8.44 脂肪:9.43 骨:8.38 皮膚:9.03
CAGE 大脳:3.32 小脳:- 脳幹:3.45 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.24 網膜:- 目:- 動脈:2.40 静脈:- リンパ節:2.36 末梢血:- 脾臓:2.14 胸腺:1.85 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.45 皮膚:3.25
RNA-seq 大脳:17.21 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:218.10 胎盤:55.20 前立腺:- 卵巣:23 精巣:7.40 心臓:130.20 骨格筋:- 食道:- 胃:196.40 腸:37 結腸:158.60     肝臓:45.30        肺:90.40    膀胱:132.40 腎臓:56.40 下垂体:439.20 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:122 乳腺:65.30 唾液腺:54
GeneChip 子宮:10.08 胎盤:10.04 前立腺:9.63 卵巣:9.95 精巣:9.06 心臓:9.58 骨格筋:9.07 食道:- 胃:9.61 腸:9.29 結腸:- 肝臓:9.12 肺:9.50 膀胱:9.56 腎臓:9.25 下垂体:9.85 甲状腺:- 副腎:9.67 膵臓:8.73 乳腺:9.53 唾液腺:9.11
CAGE 子宮:3.23 胎盤:3.53 前立腺:3.30 卵巣:3.26 精巣:2.19 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.39 腸:2.78 結腸:3.27     肝臓:3.12    肺:3.10 膀胱:3.30 腎臓:- 下垂体:3.64 甲状腺:- 副腎:3.45 膵臓:3.04 乳腺:3.13 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:3.71 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:7.43        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001164205
Gene ID 66078
Unigene ID Mm.379100
Probe set ID 1431593_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000035585

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_001077446, NM_024075
ラット[1]  NM_001006968, NM_024075

染色体

7A1  [3,644,977  -  3,652,625]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11125038
11217851
11591653
12466851
12477932
14610273
15489334
15782199
16141072
16141073
18799693
21677750

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0008033  tRNA processing
GO:0006388  tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
GO:0000379  tRNA-type intron splice site recognition and cleavage

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0005634  nucleus
GO:0000214  tRNA-intron endonuclease complex

Molecular Function

GO:0004519  endonuclease activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0004518  nuclease activity
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0005515  protein binding
GO:0000213  tRNA-intron endonuclease activity