tripartite motif-containing 13

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同義遺伝子名

RNF77, Putative tumor suppressor RFP2, tripartite motif protein 13, Trim13, LEU5, 3110001L12Rik, Ret finger protein 2, Tripartite motif-containing protein 13, Rfp2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.25 小脳:6.54 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.58 脊柱:7.81 網膜:6.28 目:7 動脈:- 静脈:6.93 リンパ節:6.03 末梢血:- 脾臓:5.54 胸腺:- 骨髄:6.21 脂肪:6.85 骨:6.45 皮膚:8.13
CAGE 大脳:1.65 小脳:- 脳幹:2.09 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.11 網膜:- 目:- 動脈:1.32 静脈:- リンパ節:0.83 末梢血:- 脾臓:1.12 胸腺:1.50 骨髄:- 脂肪:- 骨:0.63 皮膚:1.86
RNA-seq 大脳:1.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.94 胎盤:7.44 前立腺:6.98 卵巣:7.63 精巣:9.34 心臓:7.48 骨格筋:7.60 食道:- 胃:7.32 腸:5.92 結腸:- 肝臓:5.45 肺:6.93 膀胱:7.75 腎臓:7.55 下垂体:7.01 甲状腺:- 副腎:6.41 膵臓:6.91 乳腺:7.06 唾液腺:5.76
CAGE 子宮:1.50 胎盤:2.00 前立腺:0.51 卵巣:1.55 精巣:2.36 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.75 腸:0.84 結腸:0.57     肝臓:0.78    肺:1.62 膀胱:1.89 腎臓:- 下垂体:1.92 甲状腺:- 副腎:1.82 膵臓:1.61 乳腺:0.99 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.90 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.11        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001164220
Gene ID 66597
Unigene ID -
Probe set ID 1417888_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000035235

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_001007278, NM_005798, NM_052811, NM_213590
ラット[1]  NM_001012210, NM_005798, NM_052811, NM_213590

染色体

14D1  [62,217,063  -  62,224,783]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000315  Zinc finger, B-box

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11161783
11217851
11331580
12466851
12477932
12904583
14610273
14636997
15188451
15618518
16141072
16141073
17351108
17967808
18287559
18799693
21186355

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030433  ER-associated protein catabolic process
GO:0010942  positive regulation of cell death
GO:0043123  positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade
GO:0016239  positive regulation of macroautophagy
GO:0043161  proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0051865  protein autoubiquitination
GO:0007165  signal transduction

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0005789  endoplasmic reticulum membrane
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005622  intracellular
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0016874  ligase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0004871  signal transducer activity
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270  zinc ion binding