pseudouridine synthase 3

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同義遺伝子名

pseudouridine synthase 3, tRNA-uridine isomerase 3, 2610020J05Rik, Pus3, tRNA pseudouridylate synthase 3, tRNA pseudouridine synthase 3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:5.20 小脳:36.80 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:7.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:26.30 胸腺:29.60 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:5.66 小脳:5.59 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.86 脊柱:5.54 網膜:5.72 目:5.43 動脈:- 静脈:5.78 リンパ節:7.05 末梢血:- 脾臓:6.97 胸腺:- 骨髄:6.17 脂肪:5.71 骨:5.78 皮膚:5.90
CAGE 大脳:2.71 小脳:- 脳幹:2.65 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.62 網膜:- 目:- 動脈:2.66 静脈:- リンパ節:3.94 末梢血:- 脾臓:2.87 胸腺:3.77 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.72 皮膚:2.78
RNA-seq 大脳:0.93 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:34.50 精巣:36.90 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:9.40 乳腺:- 唾液腺:54
GeneChip 子宮:6.28 胎盤:5.61 前立腺:5.86 卵巣:6 精巣:5.76 心臓:5.68 骨格筋:6.97 食道:- 胃:5.85 腸:5.83 結腸:- 肝臓:5.51 肺:5.39 膀胱:5.72 腎臓:5.90 下垂体:6.45 甲状腺:- 副腎:5.58 膵臓:5.93 乳腺:6.10 唾液腺:5.62
CAGE 子宮:3.23 胎盤:2.42 前立腺:2.67 卵巣:3.24 精巣:0.75 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.60 腸:2.49 結腸:2.55     肝臓:2.16    肺:2.85 膀胱:2.90 腎臓:- 下垂体:3.06 甲状腺:- 副腎:2.67 膵臓:2.56 乳腺:2.81 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.44 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.26        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_023292
Gene ID 67049
Unigene ID Mm.252879
Probe set ID 1418491_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000032103

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_031307
ラット[1]  NM_001108134

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001406  Pseudouridine synthase I, TruA
IPR020103  Pseudouridine synthase, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11027153
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
15489334
15782199
16141072
16141073
17170069
17967808
18799693
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001522  pseudouridine synthesis
GO:0009451  RNA modification
GO:0008033  tRNA processing
GO:0031119  tRNA pseudouridine synthesis

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0016853  isomerase activity
GO:0009982  pseudouridine synthase activity
GO:0003723  RNA binding