LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, 1010001J12Rik, SMX4, 6030401D18Rik, USS2, Lsm3

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:18.40

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:8.51

小脳:8.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:8.68

脊柱:8.58

網膜:8.59

目:9.14

動脈:-

静脈:9.68

リンパ節:9.54

末梢血:-

脾臓:9.56

胸腺:-

骨髄:10.38

脂肪:9.47

骨:10.47

皮膚:9.36

CAGE

大脳:2.60

小脳:-

脳幹:2.35

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:2.51

網膜:-

目:-

動脈:2.55

静脈:-

リンパ節:2.96

末梢血:-

脾臓:3.40

胸腺:3.56

骨髄:-

脂肪:-

骨:2.53

皮膚:2.89

RNA-seq

大脳:6.01

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:7.40

心臓:-

骨格筋:35.50

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:9.27

胎盤:8.98

前立腺:8.44

卵巣:9.53

精巣:9.45

心臓:9.70

骨格筋:9.26

食道:-

胃:8.87

腸:9.66

結腸:-

肝臓:7.75

肺:8.70

膀胱:9.07

腎臓:8.65

下垂体:9.08

甲状腺:-

副腎:9.13

膵臓:7.56

乳腺:9.29

唾液腺:8.79

CAGE

子宮:2.56

胎盤:2.92

前立腺:1.94

卵巣:2.70

精巣:4.05

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:2.26

腸:3.36

結腸:3.24

肝臓:1.94

肺:2.57

膀胱:2.52

腎臓:-

下垂体:2.96

甲状腺:-

副腎:2.35

膵臓:2.03

乳腺:2.61

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:5.53

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:3.01

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_026309
Gene ID	67678
Unigene ID	Mm.410956
Probe set ID	1448536_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000090846

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]	NM_014463
ラット[1]	NM_001106611

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006397	mRNA processing
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005634	nucleus
GO:0030529	ribonucleoprotein complex
GO:0005681	spliceosomal complex
GO:0046540	U4/U6 x U5 tri-snRNP complex

Molecular Function

GO:0003723	RNA binding
GO:0030629	U6 snRNA 3'-end binding

LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function